66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4382 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 		 498 aa  1026    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  39.54 
 
 		 470 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  40.72 
 
 		 477 aa  354  2e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  37.99 
 
 		 478 aa  323  6e-87  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  37.07 
 
 		 493 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  37.92 
 
 		 475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  35.14 
 
 		 499 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  36.25 
 
 		 541 aa  296  5e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  36.36 
 
 		 499 aa  293  4e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  35.76 
 
 		 478 aa  291  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  34.91 
 
 		 475 aa  286  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  30.41 
 
 		 476 aa  231  2e-59  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  25.99 
 
 		 478 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  22.48 
 
 		 452 aa  96.7  8e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  23.08 
 
 		 465 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  21.84 
 
 		 439 aa  78.2  0.0000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  22.22 
 
 		 502 aa  75.1  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0873  L-arabinose isomerase  21.02 
 
 		 501 aa  66.2  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  20.27 
 
 		 452 aa  66.2  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  21.67 
 
 		 496 aa  64.3  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2027  L-arabinose isomerase  22.71 
 
 		 501 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.929629  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2327  L-arabinose isomerase  21.73 
 
 		 501 aa  62.8  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.305098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6217  L-arabinose isomerase  20.78 
 
 		 493 aa  60.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.620258 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3996  L-arabinose isomerase  21.6 
 
 		 501 aa  60.5  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0451143  normal  0.502282 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2151  L-arabinose isomerase  21.55 
 
 		 503 aa  58.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1154  L-arabinose isomerase  21.05 
 
 		 495 aa  58.2  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77803  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2066  L-arabinose isomerase  20.05 
 
 		 500 aa  57  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000205701  hitchhiker  0.000020018 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1979  L-arabinose isomerase  20.05 
 
 		 500 aa  57  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000173872  normal  0.0652997 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1995  L-arabinose isomerase  20.05 
 
 		 500 aa  57  0.0000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00575721  unclonable  0.000026783 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3537  L-arabinose isomerase  21.33 
 
 		 500 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0067  L-arabinose isomerase  21.33 
 
 		 500 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  21.85 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3595  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000176548 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0066  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0064  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0849875  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0064  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.203815  normal  0.780498 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00063  hypothetical protein  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00064  L-arabinose isomerase  21.51 
 
 		 500 aa  55.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2734  L-arabinose isomerase  20.11 
 
 		 496 aa  54.7  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1238  L-arabinose isomerase  20.19 
 
 		 496 aa  53.5  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2753  L-arabinose isomerase  21.49 
 
 		 502 aa  53.1  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0767064  decreased coverage  0.00000377093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2243  L-arabinose isomerase  20.89 
 
 		 501 aa  53.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000390243 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0113  L-arabinose isomerase  20.95 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  21.29 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0054  L-arabinose isomerase  21.39 
 
 		 500 aa  52.8  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0106  L-arabinose isomerase  20.95 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2731  L-arabinose isomerase  21.66 
 
 		 496 aa  52.8  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.746734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0113  L-arabinose isomerase  20.95 
 
 		 500 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2001  L-arabinose isomerase  21.01 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1887  L-arabinose isomerase  21.01 
 
 		 500 aa  51.6  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.45012  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0498  L-arabinose isomerase  19.14 
 
 		 502 aa  51.6  0.00003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.730829  normal  0.520823 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0326  L-arabinose isomerase  18.85 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.562727 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0108  L-arabinose isomerase  20.95 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0109  L-arabinose isomerase  20.95 
 
 		 500 aa  52  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.309204 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2259  L-arabinose isomerase  21.01 
 
 		 500 aa  50.8  0.00005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1914  L-arabinose isomerase  21.27 
 
 		 502 aa  50.8  0.00005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3203  L-arabinose isomerase  22.1 
 
 		 497 aa  48.5  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0609  L-arabinose isomerase  20.39 
 
 		 500 aa  48.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.97882  normal  0.159934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  19.66 
 
 		 502 aa  47.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  21.93 
 
 		 440 aa  47.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2897  L-arabinose isomerase  20.57 
 
 		 494 aa  46.2  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.629446  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4713  L-arabinose isomerase  20.82 
 
 		 497 aa  46.2  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1121  L-arabinose isomerase  19.33 
 
 		 502 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3664  L-arabinose isomerase  20.05 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  21.82 
 
 		 441 aa  44.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>