25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6560 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  100 
 
 
499 aa  1033    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  65.76 
 
 
541 aa  654    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  66.33 
 
 
493 aa  703    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0399  putative L-arabinose isomerase  73.64 
 
 
478 aa  749    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.860372  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6090  putative L-arabinose isomerase protein  68.49 
 
 
475 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  47.05 
 
 
470 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3280  putative L-arabinose isomerase protein  42.6 
 
 
478 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.226314  normal  0.533045 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  41.51 
 
 
475 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  41.49 
 
 
477 aa  381  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  38.1 
 
 
499 aa  347  2e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3616  L-arabinose isomerase  39.15 
 
 
476 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.779197  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  35.14 
 
 
498 aa  303  5.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  26.17 
 
 
478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2888  L-arabinose isomerase  24.88 
 
 
452 aa  104  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.434523  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1033  L-arabinose isomerase  21.5 
 
 
465 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000049306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  21.04 
 
 
445 aa  61.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  22.19 
 
 
452 aa  57.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  21.95 
 
 
440 aa  50.4  0.00007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  24.25 
 
 
441 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1863  L-arabinose isomerase  23.72 
 
 
502 aa  46.6  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0382  L-arabinose isomerase  21.45 
 
 
502 aa  45.8  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3664  L-arabinose isomerase  27.07 
 
 
501 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2066  L-arabinose isomerase  21.55 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000180583  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2397  L-arabinose isomerase  25.26 
 
 
496 aa  44.3  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2140  L-arabinose isomerase  23.13 
 
 
500 aa  43.9  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.47731  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>