18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2456 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  865    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  73.97 
 
 
441 aa  597  1e-169  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  26.47 
 
 
439 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  30.29 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  26.02 
 
 
445 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  23.81 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  23.81 
 
 
474 aa  60.5  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  23.23 
 
 
468 aa  55.5  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  24.3 
 
 
467 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  21.99 
 
 
498 aa  51.6  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  21.95 
 
 
499 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  27.36 
 
 
386 aa  50.1  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  23.41 
 
 
470 aa  49.7  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  22.13 
 
 
486 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  25.81 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  24.71 
 
 
496 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0672  L-arabinose isomerase  29.36 
 
 
496 aa  43.1  0.01  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>