25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0468 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 		 467 aa  965    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  49.68 
 
 		 468 aa  499  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  49.78 
 
 		 486 aa  499  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  47.84 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  47.84 
 
 		 474 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  47.63 
 
 		 474 aa  461  9.999999999999999e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  30.23 
 
 		 496 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  28.96 
 
 		 493 aa  158  2e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  28.11 
 
 		 494 aa  151  3e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0200  L-fucose isomerase related protein  26.86 
 
 		 494 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213498  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  28.46 
 
 		 445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  23.87 
 
 		 439 aa  99.8  9e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  23.92 
 
 		 452 aa  76.6  0.0000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  28.25 
 
 		 413 aa  59.3  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  27.63 
 
 		 441 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  20.83 
 
 		 371 aa  53.5  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  21.49 
 
 		 470 aa  53.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  24.29 
 
 		 440 aa  53.1  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  23.93 
 
 		 471 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4813  L-fucose isomerase-like protein  22.65 
 
 		 477 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  23.88 
 
 		 470 aa  47.4  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0584  L-arabinose isomerase  19.48 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  25.77 
 
 		 477 aa  46.2  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  25.21 
 
 		 478 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  29.9 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>