19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2798 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 		 468 aa  978    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  81.52 
 
 		 486 aa  800    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  51.92 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  51.71 
 
 		 474 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  51.92 
 
 		 474 aa  510  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  49.68 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  27.73 
 
 		 496 aa  146  6e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0200  L-fucose isomerase related protein  24.53 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  24.74 
 
 		 494 aa  126  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  26.43 
 
 		 445 aa  111  3e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  23.95 
 
 		 493 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  24.6 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  22.51 
 
 		 452 aa  79.7  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  23.23 
 
 		 440 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  27.23 
 
 		 441 aa  49.7  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  24.19 
 
 		 371 aa  46.6  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  21.3 
 
 		 413 aa  45.4  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  22.57 
 
 		 477 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  22.79 
 
 		 471 aa  43.9  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>