22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_1654 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  100 
 
 
413 aa  819    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0267  hypothetical protein  39 
 
 
395 aa  267  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0597418  hitchhiker  0.000000218565 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0743  hypothetical protein  39.64 
 
 
367 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000046156 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0212  hypothetical protein  39.78 
 
 
362 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.931385 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1320  hypothetical protein  36.03 
 
 
375 aa  225  1e-57  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0227  hypothetical protein  36.79 
 
 
375 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0329  hypothetical protein  25.93 
 
 
371 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  29.33 
 
 
445 aa  102  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  30.42 
 
 
386 aa  79  0.0000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1559  L-fucose isomerase and related proteins-like  25.94 
 
 
451 aa  72.4  0.00000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.252286  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  27.73 
 
 
471 aa  68.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  19.72 
 
 
439 aa  62.4  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  28.27 
 
 
467 aa  60.1  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  26.65 
 
 
452 aa  58.2  0.0000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  24.61 
 
 
470 aa  57  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  25.57 
 
 
477 aa  53.9  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  21.98 
 
 
473 aa  48.1  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  26.04 
 
 
379 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1106  L-fucose isomerase and related protein-like protein  26.94 
 
 
435 aa  48.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.818245  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  21.98 
 
 
473 aa  48.1  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  22.28 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5095  arsenite-activated ATPase ArsA  35.71 
 
 
729 aa  43.1  0.01  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>