18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2128 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  81.52 
 
 		 468 aa  800    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  100 
 
 		 486 aa  1009    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  52.15 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  52.26 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  52.15 
 
 		 474 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  49.78 
 
 		 467 aa  499  1e-140  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  27.65 
 
 		 496 aa  139  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0200  L-fucose isomerase related protein  25.2 
 
 		 494 aa  127  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.213498  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  24.7 
 
 		 494 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  25.67 
 
 		 445 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  23.82 
 
 		 493 aa  108  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  24.92 
 
 		 439 aa  84.3  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  21.79 
 
 		 452 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  25.77 
 
 		 441 aa  53.9  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  22.27 
 
 		 471 aa  50.8  0.00006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  22.13 
 
 		 440 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  22.67 
 
 		 477 aa  47.4  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  24.67 
 
 		 470 aa  43.5  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>