24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1018 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_1018  L-fucose isomerase and related protein  100 
 
 
441 aa  871    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.856807 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2456  hypothetical protein  73.97 
 
 
440 aa  617  1e-175  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.317719  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0491  L-fucose isomerase-like protein  25.61 
 
 
439 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  29.58 
 
 
452 aa  114  3e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  26.44 
 
 
445 aa  103  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  26.94 
 
 
467 aa  63.9  0.000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  25.77 
 
 
486 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  25.87 
 
 
468 aa  57.8  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3246  fucose isomerase domain-containing protein  24.23 
 
 
474 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0905  fucose isomerase domain-containing protein  24.23 
 
 
474 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3380  L-fucose isomerase-like protein  24.23 
 
 
474 aa  57.4  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4382  L-fucose isomerase-like protein  22.77 
 
 
498 aa  57  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00643603  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1733  L-fucose isomerase related protein  22.43 
 
 
496 aa  53.1  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000501597  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6560  putative L-arabinose isomerase  24.25 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0707  L-fucose isomerase-like protein  23.02 
 
 
494 aa  50.8  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1032  hypothetical protein  28.36 
 
 
379 aa  47.4  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.775746 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  24.69 
 
 
478 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3096  putative L-arabinose isomerase protein  23.7 
 
 
541 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.695467 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2002  hypothetical protein  27.23 
 
 
386 aa  44.7  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0430  putative L-arabinose isomerase protein  23.31 
 
 
475 aa  44.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3469  L-fucose isomerase-like protein  23.5 
 
 
493 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000257161  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2038  putative L-arabinose isomerase protein  21.38 
 
 
470 aa  43.9  0.005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.787291  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2430  putative L-arabinose isomerase protein  23.59 
 
 
493 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0201601  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0648  L-arabinose isomerase  32.98 
 
 
496 aa  43.1  0.009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0388449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>