39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0832 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0832  L-fucose isomerase  100 
 
 		 477 aa  978    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0071314  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3985  L-fucose isomerase _2 domain protein  68.37 
 
 		 471 aa  664    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.372603  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3126  L-fucose isomerase 2 domain-containing protein  65.38 
 
 		 470 aa  621  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0738965  normal  0.0115763 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0610  L-fucose isomerase N-terminal_2 domain-containing protein  55.17 
 
 		 473 aa  548  1e-154  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.194613  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0624  L-fucose isomerase 1 domain-containing protein  55.17 
 
 		 473 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1608  L-fucose isomerase-like protein  49.35 
 
 		 471 aa  485  1e-136  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3318  putative L-fucose isomerase  24.95 
 
 		 539 aa  101  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.491838 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3920  L-fucose isomerase _2 domain protein  24.52 
 
 		 550 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2628  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.7 
 
 		 445 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3155  L-fucose isomerase  22.93 
 
 		 597 aa  79.7  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0410  L-fucose isomerase  23.23 
 
 		 606 aa  79.7  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.308786  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2812  L-fucose isomerase _2 domain protein  22.4 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1048  L-fucose isomerase  22.63 
 
 		 597 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2489  L-fucose isomerase  23.94 
 
 		 593 aa  78.2  0.0000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09570  L-fucose isomerase  22.94 
 
 		 603 aa  77  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1448  L-fucose isomerase  23.81 
 
 		 588 aa  76.3  0.000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2073  L-fucose isomerase  21.79 
 
 		 604 aa  72.4  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0870  L-fucose isomerase  25.76 
 
 		 590 aa  69.7  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3213  L-fucose isomerase  24.13 
 
 		 596 aa  68.2  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02614  hypothetical protein  22.38 
 
 		 586 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3121  L-fucose isomerase  25.69 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413677  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3201  L-fucose isomerase  25.69 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02653  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0886  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4066  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.456623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3301  L-fucose isomerase  25.69 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3138  L-fucose isomerase  25.69 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.653551 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3186  L-fucose isomerase  25.69 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.290864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2943  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.301551  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0910  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3107  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000142364  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2946  L-fucose isomerase  22.38 
 
 		 591 aa  62.4  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355752  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1832  L-fucose isomerase  23.4 
 
 		 592 aa  60.5  0.00000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.275484  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1654  hypothetical protein  25.57 
 
 		 413 aa  53.9  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2128  L-fucose isomerase-like protein  22.67 
 
 		 486 aa  53.9  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.277865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2798  L-fucose isomerase-like protein  22.57 
 
 		 468 aa  53.5  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0468  L-fucose isomerase-like protein  24.04 
 
 		 467 aa  53.5  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0751  L-arabinose isomerase  24.47 
 
 		 478 aa  50.4  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.148644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2587  L-fucose isomerase and related proteins-like protein  25.49 
 
 		 452 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.21577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>