More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0822 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 231 aa  468  1.0000000000000001e-131  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 225 aa  97.8  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 232 aa  94.4  1e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  29.02 
 
 		 228 aa  94  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.65 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 219 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 219 aa  90.9  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.65 
 
 		 226 aa  90.1  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 221 aa  89.7  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 219 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 217 aa  87.4  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  30.22 
 
 		 221 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 216 aa  87  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 220 aa  86.7  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 220 aa  86.3  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 215 aa  86.3  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 226 aa  85.9  5e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  28.63 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.65 
 
 		 222 aa  84  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 217 aa  83.2  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 219 aa  83.2  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.51 
 
 		 226 aa  82.4  0.000000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  28.96 
 
 		 220 aa  82.4  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 220 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 222 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  27.73 
 
 		 218 aa  80.5  0.00000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.65 
 
 		 232 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.27 
 
 		 217 aa  79.7  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 		 218 aa  80.1  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  28.51 
 
 		 217 aa  80.1  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  27.8 
 
 		 232 aa  79.3  0.00000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  29.06 
 
 		 223 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  27.65 
 
 		 220 aa  78.6  0.00000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  27.1 
 
 		 218 aa  78.6  0.00000000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0506  phosphate uptake regulator, PhoU  28.51 
 
 		 232 aa  78.2  0.00000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.510755 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.3 
 
 		 218 aa  78.2  0.00000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 238 aa  78.2  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  29.15 
 
 		 223 aa  77.4  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  28.84 
 
 		 236 aa  77.4  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.83 
 
 		 226 aa  76.3  0.0000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  30.81 
 
 		 215 aa  76.3  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 		 219 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.84 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2984  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 216 aa  75.9  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  27.52 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 		 228 aa  75.5  0.0000000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.83 
 
 		 220 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  28.76 
 
 		 217 aa  74.7  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  28.91 
 
 		 232 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  29.46 
 
 		 224 aa  74.7  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  25.23 
 
 		 214 aa  74.7  0.000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 		 230 aa  73.9  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  23.32 
 
 		 233 aa  73.9  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  29.6 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  28.17 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 216 aa  73.9  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  27.1 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  29.36 
 
 		 216 aa  73.6  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  28.83 
 
 		 237 aa  73.6  0.000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  30.45 
 
 		 219 aa  73.6  0.000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  30.8 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0552  phosphate uptake regulator  26.27 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.5092700000000001e-19 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  27.4 
 
 		 240 aa  72.4  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  28.51 
 
 		 223 aa  72.4  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  26.85 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  26.34 
 
 		 222 aa  72  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  27.52 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 218 aa  71.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  27.59 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  27.44 
 
 		 218 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  26.15 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.44 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  28.38 
 
 		 224 aa  70.9  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  26.15 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  25.58 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4545  phosphate uptake regulator, PhoU  32.96 
 
 		 234 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.459645  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 222 aa  70.5  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  27.44 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  25.69 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  23.77 
 
 		 233 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 231 aa  69.7  0.00000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  27.15 
 
 		 223 aa  69.7  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 228 aa  70.1  0.00000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>