More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_0659 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  100 
 
 		 215 aa  428  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.39 
 
 		 224 aa  181  8.000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  44.19 
 
 		 226 aa  179  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  39.61 
 
 		 222 aa  163  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  43.78 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  43.27 
 
 		 228 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  40.67 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 		 232 aa  145  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  40.67 
 
 		 217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  41.06 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  40.85 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  40.39 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  44.02 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  41.11 
 
 		 228 aa  138  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 226 aa  137  8.999999999999999e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  38.35 
 
 		 225 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  37.07 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.38 
 
 		 229 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 228 aa  136  3.0000000000000003e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  39.9 
 
 		 217 aa  135  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  36.14 
 
 		 220 aa  134  9.999999999999999e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  37.07 
 
 		 226 aa  133  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  40.48 
 
 		 224 aa  131  6.999999999999999e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 220 aa  131  9e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  34.13 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 227 aa  131  9e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.1 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.93 
 
 		 256 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  35.12 
 
 		 218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  34.13 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 256 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 256 aa  129  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  34.31 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  35.1 
 
 		 233 aa  128  6e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 240 aa  128  8.000000000000001e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.02 
 
 		 234 aa  127  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  37.31 
 
 		 218 aa  127  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  37.2 
 
 		 243 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 231 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  36.71 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.41 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 253 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  33.65 
 
 		 231 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 242 aa  125  6e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.41 
 
 		 242 aa  125  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 223 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.59 
 
 		 219 aa  124  8.000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 227 aa  124  1e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.41 
 
 		 242 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 222 aa  124  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.41 
 
 		 253 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 246 aa  123  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 241 aa  123  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  34.13 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.86 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  32.21 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 222 aa  121  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  31.22 
 
 		 232 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  39.05 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 		 236 aa  120  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 232 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.02 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.77 
 
 		 232 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 231 aa  118  7e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  36.02 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  33.33 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  34.76 
 
 		 237 aa  117  9e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  34.8 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  30.77 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  35.5 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>