More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0142 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 
221 aa  445  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  96.83 
 
 
221 aa  437  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  87.33 
 
 
221 aa  403  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  55.66 
 
 
220 aa  243  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  46.45 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  46.86 
 
 
229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 
215 aa  187  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  44.81 
 
 
222 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  45.75 
 
 
217 aa  181  6e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  45.67 
 
 
222 aa  180  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.89 
 
 
228 aa  178  4e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  48.31 
 
 
223 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  48.79 
 
 
223 aa  179  4e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  48.31 
 
 
223 aa  179  4e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  47.83 
 
 
223 aa  177  9e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  47.83 
 
 
224 aa  177  1e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  47.34 
 
 
223 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 
219 aa  175  4e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  42.4 
 
 
234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  41.01 
 
 
217 aa  171  5.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  41.98 
 
 
217 aa  169  4e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  39.53 
 
 
218 aa  168  6e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 
221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 
218 aa  164  8e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  40.76 
 
 
225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 
219 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  44.66 
 
 
227 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  43.93 
 
 
220 aa  157  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  39.61 
 
 
243 aa  155  6e-37  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 
220 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  42.03 
 
 
231 aa  153  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  43 
 
 
233 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  42.03 
 
 
233 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 
219 aa  150  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  42.03 
 
 
233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  37.31 
 
 
220 aa  144  7.0000000000000006e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 
227 aa  144  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  35.27 
 
 
233 aa  143  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 
226 aa  142  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  35.71 
 
 
236 aa  142  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 
234 aa  142  4e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 
240 aa  142  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  36.36 
 
 
241 aa  140  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 
241 aa  139  3e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 
240 aa  139  4.999999999999999e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  37.5 
 
 
242 aa  138  7e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 
236 aa  137  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 
236 aa  137  8.999999999999999e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  33.33 
 
 
232 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  36.54 
 
 
237 aa  137  2e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
216 aa  136  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  37.8 
 
 
242 aa  136  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  36.36 
 
 
243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.18 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.7 
 
 
217 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 
242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  37.32 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
242 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  32.26 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  36.06 
 
 
238 aa  134  7.000000000000001e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  36.06 
 
 
240 aa  134  8e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  36.06 
 
 
240 aa  134  8e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.17 
 
 
217 aa  134  8e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 
256 aa  134  9e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  36.15 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  36.15 
 
 
237 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.19 
 
 
237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 
240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 
239 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
240 aa  132  3e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 
237 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  37.44 
 
 
237 aa  132  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
243 aa  132  3e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 
240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  35.89 
 
 
244 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 
246 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 
239 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.06 
 
 
240 aa  132  5e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 
242 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  132  5e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.06 
 
 
240 aa  132  5e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 
241 aa  132  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>