More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4578 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
226 aa  455  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 
233 aa  206  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  48.15 
 
 
223 aa  204  7e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  48.15 
 
 
233 aa  202  3e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.91 
 
 
228 aa  202  4e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  48.15 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  47.22 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  47.22 
 
 
223 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  47.22 
 
 
223 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  47.69 
 
 
233 aa  199  3e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  45.83 
 
 
229 aa  196  3e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  47.22 
 
 
222 aa  196  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  46.76 
 
 
224 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  44.7 
 
 
231 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  43.18 
 
 
227 aa  181  7e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  41.01 
 
 
237 aa  158  5e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  38.07 
 
 
233 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
256 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  39.63 
 
 
256 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
256 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.81 
 
 
247 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  37.17 
 
 
240 aa  154  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
217 aa  152  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  37.61 
 
 
235 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  39.17 
 
 
242 aa  152  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.71 
 
 
253 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 
235 aa  152  5e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 
242 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  39.63 
 
 
242 aa  152  5e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  38.71 
 
 
253 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 
256 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 
217 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 
226 aa  151  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  36.41 
 
 
242 aa  150  2e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  36.53 
 
 
243 aa  149  4e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  36.89 
 
 
225 aa  148  7e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  35.84 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  35.84 
 
 
234 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  35.84 
 
 
234 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  36.87 
 
 
233 aa  145  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  35.84 
 
 
234 aa  146  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.37 
 
 
224 aa  146  3e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 
242 aa  145  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 
219 aa  145  7.0000000000000006e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 
243 aa  144  8.000000000000001e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  38.01 
 
 
240 aa  144  8.000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  35.51 
 
 
238 aa  144  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  35.4 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  35.4 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.22 
 
 
234 aa  144  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  37.84 
 
 
239 aa  143  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 
218 aa  143  2e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 
221 aa  143  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  37.09 
 
 
238 aa  143  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 
215 aa  142  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 
234 aa  143  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  34.38 
 
 
234 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 
238 aa  142  5e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 
239 aa  141  6e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0745  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 
221 aa  142  6e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000133357  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 
239 aa  141  7e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  37.1 
 
 
241 aa  141  7e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  34.96 
 
 
234 aa  141  8e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
234 aa  141  9.999999999999999e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  35.29 
 
 
240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  36.28 
 
 
231 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  36.77 
 
 
246 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
219 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  34.95 
 
 
216 aa  139  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
239 aa  139  3e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 
236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  33.8 
 
 
242 aa  138  6e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  32.43 
 
 
237 aa  138  6e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 
232 aa  138  6e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  33.8 
 
 
244 aa  138  7e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  33.8 
 
 
241 aa  138  7.999999999999999e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  33.8 
 
 
243 aa  138  7.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 
235 aa  138  7.999999999999999e-32  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  35.87 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  35.87 
 
 
237 aa  138  8.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  35.84 
 
 
236 aa  137  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 
229 aa  137  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  36.84 
 
 
215 aa  137  1e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 
238 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  32.43 
 
 
237 aa  137  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 
233 aa  137  1e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
218 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
218 aa  137  1e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>