More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1616 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 228 aa  458  9.999999999999999e-129  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  78.07 
 
 		 228 aa  362  2e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  78.95 
 
 		 228 aa  356  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  74.89 
 
 		 219 aa  325  4.0000000000000003e-88  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  70.18 
 
 		 228 aa  319  3e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  64.47 
 
 		 228 aa  296  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  63.16 
 
 		 228 aa  293  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  56.58 
 
 		 232 aa  268  5e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  52.19 
 
 		 228 aa  228  6e-59  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  53.33 
 
 		 223 aa  220  9.999999999999999e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  41.06 
 
 		 215 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 215 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 229 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  37.7 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  42.71 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.94 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.6 
 
 		 228 aa  125  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  36.89 
 
 		 224 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 226 aa  115  5e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 221 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.55 
 
 		 218 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 230 aa  111  8.000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 214 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.97 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 233 aa  110  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.71 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 236 aa  108  1e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 222 aa  107  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 		 227 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 		 226 aa  106  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 		 219 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.51 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 221 aa  102  4e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 222 aa  102  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 215 aa  102  5e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 238 aa  102  5e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 214 aa  100  1e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.34 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3555  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 233 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 		 216 aa  100  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  27.7 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.22 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  32.68 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 		 218 aa  99.4  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  28.25 
 
 		 233 aa  98.6  8e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 223 aa  97.8  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  29.58 
 
 		 220 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 233 aa  97.8  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  29.25 
 
 		 244 aa  97.4  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  29.41 
 
 		 243 aa  97.4  1e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 		 224 aa  97.4  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 242 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  30.26 
 
 		 242 aa  97.4  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  29.41 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  29.6 
 
 		 244 aa  97.4  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  29.7 
 
 		 237 aa  97.1  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 256 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 219 aa  97.1  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  97.1  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 225 aa  96.7  3e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.25 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  31.55 
 
 		 219 aa  96.3  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  31 
 
 		 217 aa  96.3  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 222 aa  96.3  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 238 aa  96.3  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  29.21 
 
 		 241 aa  95.5  5e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>