More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0382 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  58.11 
 
 		 225 aa  260  1e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 222 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.78 
 
 		 224 aa  132  3.9999999999999996e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  33.01 
 
 		 215 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 		 222 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 219 aa  125  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 229 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 235 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.61 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  37.86 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 242 aa  114  8.999999999999998e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 240 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 224 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 		 219 aa  112  5e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.42 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  34.27 
 
 		 242 aa  112  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 		 223 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  34.13 
 
 		 242 aa  112  6e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 		 222 aa  112  7.000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 233 aa  111  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.33 
 
 		 253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 239 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.66 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.21 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 226 aa  108  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 		 237 aa  108  6e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 235 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 243 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.63 
 
 		 226 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 217 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 220 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 		 218 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 225 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.18 
 
 		 218 aa  106  3e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  31.86 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 246 aa  105  5e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  31.86 
 
 		 240 aa  105  5e-22  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 234 aa  104  9e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 		 236 aa  104  9e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  29.72 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  29.52 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  32.26 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.66 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  32.09 
 
 		 234 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  30.7 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  29.67 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  30.19 
 
 		 236 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  28.78 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  28.82 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.52 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 229 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  30.66 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  29.25 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 227 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  28.51 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  29.27 
 
 		 218 aa  101  9e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  30.43 
 
 		 240 aa  100  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  29.3 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>