More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0265 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 237 aa  484  1e-136  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  39.39 
 
 		 237 aa  183  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  42.86 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  42.67 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  42.08 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  40 
 
 		 241 aa  178  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  43.32 
 
 		 236 aa  178  8e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  39.3 
 
 		 235 aa  176  4e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  38.74 
 
 		 241 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  38.67 
 
 		 243 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 241 aa  171  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  38.67 
 
 		 244 aa  171  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  38.67 
 
 		 244 aa  170  2e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.01 
 
 		 232 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  38.22 
 
 		 242 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  39.11 
 
 		 238 aa  169  4e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  38.22 
 
 		 243 aa  168  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  41.01 
 
 		 232 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  37.39 
 
 		 240 aa  165  4e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.72 
 
 		 234 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  40.09 
 
 		 233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  37.99 
 
 		 239 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  39.73 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 240 aa  164  1.0000000000000001e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  38.91 
 
 		 234 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  38.84 
 
 		 234 aa  162  3e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  36.67 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  39.82 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  39.82 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  39.82 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  39.82 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.27 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  39.82 
 
 		 234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  38.84 
 
 		 234 aa  161  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  39.82 
 
 		 235 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  38.99 
 
 		 235 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.98 
 
 		 247 aa  160  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  37.99 
 
 		 239 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 234 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  39.13 
 
 		 236 aa  159  4e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 234 aa  158  6e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  37.39 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.37 
 
 		 229 aa  157  2e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  34.67 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  38.07 
 
 		 234 aa  156  2e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  38.99 
 
 		 222 aa  155  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  38.36 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  37.89 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  37.89 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  37.89 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  37.89 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  37.39 
 
 		 242 aa  155  7e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  36.64 
 
 		 242 aa  155  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  37.23 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  37.23 
 
 		 237 aa  154  8e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  37.89 
 
 		 236 aa  154  9e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  37.34 
 
 		 233 aa  154  9e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  36.96 
 
 		 242 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  35.56 
 
 		 236 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  37.39 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  37.44 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  37.44 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  38.46 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  37.44 
 
 		 236 aa  154  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  37.44 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.84 
 
 		 228 aa  152  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2266  phosphate uptake regulator, PhoU  37.77 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  36.96 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  36.89 
 
 		 236 aa  152  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 253 aa  152  5e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  36.73 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  36.12 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>