More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0579 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 233 aa  467  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  82.4 
 
 		 233 aa  391  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  79.4 
 
 		 233 aa  384  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  80.69 
 
 		 234 aa  382  1e-105  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  80.6 
 
 		 233 aa  382  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  78.88 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  77.16 
 
 		 233 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  75 
 
 		 233 aa  360  8e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  74.57 
 
 		 233 aa  358  3e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  65.24 
 
 		 234 aa  315  4e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  64.96 
 
 		 235 aa  312  2.9999999999999996e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  63.4 
 
 		 235 aa  308  4e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  62.45 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  62.45 
 
 		 234 aa  299  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  62.01 
 
 		 234 aa  298  4e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  62.45 
 
 		 235 aa  298  5e-80  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  62.45 
 
 		 234 aa  296  2e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  61.57 
 
 		 234 aa  291  4e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  60.7 
 
 		 237 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  288  4e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  60.26 
 
 		 237 aa  288  5.0000000000000004e-77  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.61 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 		 234 aa  285  2.9999999999999996e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 		 234 aa  285  5e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  60.7 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  60.7 
 
 		 234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  57.46 
 
 		 235 aa  277  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 		 234 aa  266  2e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  54.35 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 235 aa  237  1e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  51.8 
 
 		 235 aa  234  1.0000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  48.33 
 
 		 240 aa  224  1e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  49.55 
 
 		 229 aa  222  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  6e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  47.83 
 
 		 242 aa  218  7e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 236 aa  218  7e-56  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  49.57 
 
 		 236 aa  218  7.999999999999999e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  50 
 
 		 237 aa  217  1e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  48.48 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  48.92 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  48.9 
 
 		 236 aa  216  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 241 aa  213  9.999999999999999e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  46.9 
 
 		 253 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  47.6 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  46.46 
 
 		 253 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  46.9 
 
 		 253 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  46.67 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 		 256 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  47.83 
 
 		 231 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  48.5 
 
 		 236 aa  211  5.999999999999999e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 256 aa  211  9e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  46.35 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  46.35 
 
 		 237 aa  209  2e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  47.64 
 
 		 236 aa  209  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  48.07 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 242 aa  208  6e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  46.85 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  46.4 
 
 		 242 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  47.27 
 
 		 239 aa  205  6e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.4 
 
 		 247 aa  204  7e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 232 aa  203  1e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  46.02 
 
 		 240 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  46.96 
 
 		 241 aa  202  5e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  46.32 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  46.96 
 
 		 243 aa  201  9.999999999999999e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 246 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  45.65 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  44.83 
 
 		 239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  46.52 
 
 		 241 aa  199  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  46.96 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  46.96 
 
 		 240 aa  199  3.9999999999999996e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>