More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0025 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 233 aa  471  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  67.1 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  66.67 
 
 		 235 aa  310  2e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  54.94 
 
 		 234 aa  261  6e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  54.94 
 
 		 235 aa  261  8e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  55.79 
 
 		 234 aa  261  8e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  53.22 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  55.41 
 
 		 241 aa  256  3e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  53.22 
 
 		 237 aa  255  4e-67  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  52.56 
 
 		 234 aa  253  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  52.56 
 
 		 234 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  54.15 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  54.15 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  54.35 
 
 		 233 aa  248  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  54.82 
 
 		 237 aa  248  7e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  51.07 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  52.59 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  51.52 
 
 		 253 aa  245  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  51.52 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  51.52 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  51.52 
 
 		 234 aa  245  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  52.99 
 
 		 233 aa  244  9.999999999999999e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  53.42 
 
 		 233 aa  243  1.9999999999999999e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  51.08 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  51.08 
 
 		 234 aa  242  3e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  51.93 
 
 		 242 aa  242  3.9999999999999997e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  50.86 
 
 		 253 aa  241  6e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  49.35 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  51.32 
 
 		 246 aa  240  2e-62  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  49.35 
 
 		 256 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  49.35 
 
 		 256 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  48.92 
 
 		 256 aa  239  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  51.13 
 
 		 229 aa  238  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 253 aa  238  8e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  51.08 
 
 		 234 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  52.36 
 
 		 233 aa  238  8e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  50.64 
 
 		 235 aa  236  2e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  48.92 
 
 		 242 aa  236  2e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  48.92 
 
 		 242 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  50.87 
 
 		 233 aa  235  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  50.64 
 
 		 235 aa  235  5.0000000000000005e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  48.05 
 
 		 242 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  51.6 
 
 		 230 aa  234  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  50.65 
 
 		 234 aa  234  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  49.79 
 
 		 236 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  50.43 
 
 		 234 aa  233  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  51.07 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 240 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  48.93 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  48.93 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  48.7 
 
 		 231 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  48.93 
 
 		 236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  49.79 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  49.79 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  49.13 
 
 		 236 aa  232  5e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  49.79 
 
 		 236 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  49.57 
 
 		 234 aa  231  5e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  49.79 
 
 		 236 aa  231  5e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  48.7 
 
 		 236 aa  231  7.000000000000001e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  50.64 
 
 		 233 aa  231  8.000000000000001e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  49.36 
 
 		 236 aa  230  1e-59  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  48.68 
 
 		 240 aa  229  3e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  49.35 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  49.55 
 
 		 247 aa  229  3e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  50.87 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 233 aa  228  7e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  49.36 
 
 		 234 aa  227  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  47.83 
 
 		 236 aa  227  2e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  47.39 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 239 aa  224  7e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  48.26 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  44.87 
 
 		 236 aa  223  2e-57  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  48.51 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  47.39 
 
 		 236 aa  222  4e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  47.81 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  47.81 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  47.81 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  47.81 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  48.92 
 
 		 236 aa  221  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  47.81 
 
 		 241 aa  222  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  47.21 
 
 		 232 aa  221  8e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 239 aa  221  8e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  48.26 
 
 		 238 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  48.26 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  48.26 
 
 		 240 aa  220  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.62 
 
 		 232 aa  221  9.999999999999999e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  48.26 
 
 		 244 aa  218  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 241 aa  218  6e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  47.37 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  47.37 
 
 		 241 aa  218  7e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>