More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1598 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
235 aa  473  1e-133  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  80.34 
 
 
234 aa  391  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  68.97 
 
 
234 aa  331  6e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  67.67 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  67.24 
 
 
234 aa  326  2.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  67.24 
 
 
234 aa  325  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  66.81 
 
 
234 aa  322  4e-87  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  65.24 
 
 
234 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  65.24 
 
 
234 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  65.24 
 
 
234 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  64.38 
 
 
234 aa  318  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  64.38 
 
 
234 aa  317  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  63.95 
 
 
234 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  63.95 
 
 
234 aa  316  2e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.95 
 
 
234 aa  314  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.52 
 
 
234 aa  314  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  63.2 
 
 
235 aa  301  4.0000000000000003e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  62.77 
 
 
237 aa  296  2e-79  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  62.77 
 
 
237 aa  295  3e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  58.33 
 
 
234 aa  278  6e-74  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  59.91 
 
 
233 aa  277  9e-74  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  57.46 
 
 
233 aa  277  1e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  57.33 
 
 
233 aa  266  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  57.21 
 
 
233 aa  266  2e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  56.14 
 
 
235 aa  263  2e-69  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  57.66 
 
 
233 aa  262  3e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  57.66 
 
 
233 aa  262  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 
233 aa  262  4e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 
235 aa  259  3e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  56.03 
 
 
235 aa  258  7e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  56.31 
 
 
234 aa  258  7e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  56.31 
 
 
233 aa  256  2e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  51.36 
 
 
229 aa  238  5.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  48.94 
 
 
235 aa  229  2e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  50.91 
 
 
235 aa  225  5.0000000000000005e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  48.51 
 
 
233 aa  223  2e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  48.7 
 
 
237 aa  204  1e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  46.22 
 
 
242 aa  202  5e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  43.64 
 
 
236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  47.03 
 
 
239 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  44.54 
 
 
231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  45.06 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  45.06 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  45.06 
 
 
236 aa  199  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  44.64 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  45.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  45.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  45.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  45.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  44.26 
 
 
236 aa  197  1.0000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  46.61 
 
 
239 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  44.83 
 
 
236 aa  196  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  43.29 
 
 
236 aa  196  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.85 
 
 
232 aa  194  1e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  46.4 
 
 
236 aa  192  3e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  43.42 
 
 
233 aa  192  4e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  41.99 
 
 
236 aa  192  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  42.32 
 
 
240 aa  192  5e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  45.81 
 
 
232 aa  191  6e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  43.17 
 
 
238 aa  190  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  43.17 
 
 
240 aa  191  1e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  43.17 
 
 
240 aa  191  1e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  42.73 
 
 
241 aa  190  1e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  41.53 
 
 
236 aa  189  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  43.38 
 
 
253 aa  189  4e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  41.41 
 
 
241 aa  188  5.999999999999999e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  42.36 
 
 
240 aa  188  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  45.33 
 
 
237 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 
237 aa  188  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  42.92 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 
256 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  40.87 
 
 
232 aa  186  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 
256 aa  186  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  42.73 
 
 
242 aa  186  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  43.38 
 
 
242 aa  187  2e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  41.82 
 
 
241 aa  187  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  42.79 
 
 
243 aa  186  3e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  42.92 
 
 
253 aa  186  3e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  44.5 
 
 
230 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  42.92 
 
 
242 aa  186  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  43.38 
 
 
253 aa  185  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  42.79 
 
 
244 aa  184  8e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  40.53 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  40.53 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  40.53 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>