More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0823 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
234 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  97.44 
 
 
234 aa  457  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  97.01 
 
 
234 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  97.01 
 
 
234 aa  456  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  96.15 
 
 
234 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  92.74 
 
 
234 aa  432  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  91.88 
 
 
234 aa  428  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  84.19 
 
 
234 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  83.76 
 
 
234 aa  395  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  80.77 
 
 
234 aa  380  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  74.79 
 
 
234 aa  362  2e-99  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  74.36 
 
 
234 aa  360  1e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  69.7 
 
 
237 aa  332  3e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  68.83 
 
 
235 aa  331  6e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  69.26 
 
 
237 aa  331  6e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1598  phosphate uptake regulator, PhoU  65.24 
 
 
235 aa  322  4e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  64.38 
 
 
234 aa  313  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.0480407 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  62.88 
 
 
233 aa  296  2e-79  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  62.01 
 
 
234 aa  296  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  63.96 
 
 
233 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7239  phosphate uptake regulator, PhoU  59.48 
 
 
235 aa  289  2e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  0.639643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  63.06 
 
 
233 aa  285  5e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  59.39 
 
 
233 aa  279  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  60.26 
 
 
233 aa  280  2e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  58.95 
 
 
233 aa  278  6e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  58.95 
 
 
233 aa  277  8e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  59.46 
 
 
233 aa  274  8e-73  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  55.41 
 
 
235 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  56.77 
 
 
234 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  58.04 
 
 
235 aa  267  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  51.52 
 
 
233 aa  245  4.9999999999999997e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  54.3 
 
 
235 aa  241  7e-63  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  51.5 
 
 
235 aa  240  2e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  49.1 
 
 
229 aa  229  4e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  48.48 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  48.48 
 
 
237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  49.54 
 
 
253 aa  211  5.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  49.78 
 
 
236 aa  211  7e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  49.08 
 
 
253 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  49.08 
 
 
256 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  49.08 
 
 
256 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  49.08 
 
 
256 aa  210  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  49.08 
 
 
256 aa  208  6e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  46.61 
 
 
236 aa  208  7e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  48.4 
 
 
242 aa  207  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  49.08 
 
 
253 aa  206  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  45.45 
 
 
236 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  45.45 
 
 
236 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  45.45 
 
 
236 aa  206  3e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  47.75 
 
 
233 aa  206  4e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  44.68 
 
 
236 aa  205  6e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  45.02 
 
 
236 aa  204  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  45.89 
 
 
242 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  48.17 
 
 
242 aa  204  1e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  45.91 
 
 
239 aa  204  1e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  45.49 
 
 
236 aa  203  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  45.92 
 
 
236 aa  204  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  45.49 
 
 
236 aa  203  2e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  45.85 
 
 
231 aa  203  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  47.71 
 
 
242 aa  203  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  45.65 
 
 
236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  45.65 
 
 
236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  45.65 
 
 
236 aa  202  3e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  46.9 
 
 
240 aa  202  3e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
241 aa  202  5e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  45.96 
 
 
236 aa  201  6e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  45.85 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.65 
 
 
232 aa  201  9.999999999999999e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  44.54 
 
 
241 aa  201  9.999999999999999e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  45.85 
 
 
240 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.62 
 
 
247 aa  201  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  43.72 
 
 
233 aa  200  9.999999999999999e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  45.22 
 
 
236 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  45.85 
 
 
238 aa  201  9.999999999999999e-51  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  44.05 
 
 
232 aa  199  3e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  45.65 
 
 
232 aa  199  3e-50  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  45.41 
 
 
243 aa  198  5e-50  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  44.98 
 
 
244 aa  198  6e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  47.96 
 
 
237 aa  197  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  44.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  44.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  44.98 
 
 
242 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  42.61 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  44.1 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>