More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1360 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  100 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  89.18 
 
 		 236 aa  435  1e-121  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  89.61 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  89.61 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  89.61 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  89.61 
 
 		 236 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  89.18 
 
 		 236 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  89.18 
 
 		 236 aa  430  1e-120  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  89.18 
 
 		 236 aa  430  1e-120  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  89.61 
 
 		 236 aa  431  1e-120  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  88.74 
 
 		 236 aa  429  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  88.31 
 
 		 236 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  88.74 
 
 		 236 aa  427  1e-119  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  87.45 
 
 		 236 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  87.01 
 
 		 236 aa  420  1e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  86.46 
 
 		 233 aa  412  1e-114  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  64.5 
 
 		 243 aa  322  2e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  64.07 
 
 		 243 aa  320  1.9999999999999998e-86  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  3e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 241 aa  315  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  62.34 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  62.77 
 
 		 242 aa  312  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  62.34 
 
 		 240 aa  313  1.9999999999999998e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  312  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  62.61 
 
 		 238 aa  312  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 241 aa  311  3.9999999999999997e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  62.77 
 
 		 244 aa  311  3.9999999999999997e-84  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  64.04 
 
 		 232 aa  309  2.9999999999999997e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 244 aa  309  2.9999999999999997e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  63.51 
 
 		 232 aa  301  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  61.47 
 
 		 232 aa  300  1e-80  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  62.33 
 
 		 236 aa  297  1e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  57.21 
 
 		 233 aa  288  4e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  53.25 
 
 		 242 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 246 aa  246  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  53.65 
 
 		 237 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  52.38 
 
 		 242 aa  244  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  51.52 
 
 		 242 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  51.08 
 
 		 241 aa  242  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  52.63 
 
 		 242 aa  240  1e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  51.52 
 
 		 256 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 235 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  48.47 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  51.08 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  51.08 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  51.08 
 
 		 256 aa  236  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.85 
 
 		 247 aa  234  6e-61  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  50.65 
 
 		 253 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  48.7 
 
 		 233 aa  232  4.0000000000000004e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  49.34 
 
 		 253 aa  230  1e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  49.78 
 
 		 253 aa  229  2e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 235 aa  227  1e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  47.84 
 
 		 239 aa  224  1e-57  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  49.12 
 
 		 234 aa  222  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 229 aa  222  4.9999999999999996e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.72 
 
 		 246 aa  221  9e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  48.29 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  48.29 
 
 		 237 aa  219  1.9999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  49.12 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  49.14 
 
 		 235 aa  219  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  49.57 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 240 aa  216  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  47.37 
 
 		 234 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  47.21 
 
 		 234 aa  215  4e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  47.81 
 
 		 234 aa  215  5e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  47.6 
 
 		 235 aa  215  5e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  45.26 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  47.58 
 
 		 234 aa  214  7e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  46.35 
 
 		 233 aa  214  8e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  45.85 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 		 233 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  46.93 
 
 		 233 aa  213  1.9999999999999998e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 237 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 		 233 aa  212  4.9999999999999996e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  47.83 
 
 		 233 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 233 aa  209  2e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  46.72 
 
 		 239 aa  208  5e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  45.81 
 
 		 233 aa  207  8e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  46.05 
 
 		 234 aa  207  9e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 233 aa  204  7e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.32 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  203  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>