More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_4267 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  100 
 
 		 243 aa  498  1e-140  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  97.53 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  94.24 
 
 		 244 aa  473  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  95.45 
 
 		 242 aa  474  1e-133  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  93.36 
 
 		 244 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  93.33 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  93.33 
 
 		 240 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  458  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  90.46 
 
 		 241 aa  457  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  93.22 
 
 		 238 aa  454  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  88.8 
 
 		 241 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  88.8 
 
 		 241 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  89.08 
 
 		 241 aa  447  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  64.07 
 
 		 231 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  63.2 
 
 		 232 aa  318  3.9999999999999996e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  318  5e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  64.66 
 
 		 236 aa  318  6e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  317  1e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  63.79 
 
 		 236 aa  316  2e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  62.5 
 
 		 236 aa  315  3e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  62.93 
 
 		 236 aa  315  4e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  63.36 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  62.93 
 
 		 236 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  65.18 
 
 		 233 aa  311  6.999999999999999e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  62.07 
 
 		 236 aa  310  1e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 232 aa  304  7e-82  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  61.04 
 
 		 232 aa  304  9.000000000000001e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  61.9 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  56.22 
 
 		 233 aa  286  2.9999999999999996e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  53.64 
 
 		 246 aa  241  6e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  49.57 
 
 		 240 aa  232  5e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  48.48 
 
 		 240 aa  228  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  48.51 
 
 		 237 aa  228  8e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 256 aa  227  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 242 aa  227  2e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 256 aa  226  3e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  49.33 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 256 aa  226  4e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  47.33 
 
 		 247 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  48.02 
 
 		 242 aa  224  7e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  49.78 
 
 		 242 aa  224  7e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 253 aa  224  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  45.96 
 
 		 241 aa  224  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  49.33 
 
 		 242 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  44.54 
 
 		 239 aa  218  7.999999999999999e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  48.87 
 
 		 235 aa  217  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  48.4 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  48.4 
 
 		 253 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 233 aa  215  5e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  46.05 
 
 		 235 aa  211  7.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  48.46 
 
 		 237 aa  210  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 240 aa  210  1e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  48.03 
 
 		 234 aa  210  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  49.35 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  45.45 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  43.78 
 
 		 239 aa  210  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  45.74 
 
 		 236 aa  208  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  48.25 
 
 		 234 aa  208  6e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  45.92 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  48.02 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  45.92 
 
 		 237 aa  207  1e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  47.37 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  46.93 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  46.49 
 
 		 234 aa  204  8e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 229 aa  204  1e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  46.93 
 
 		 233 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.41 
 
 		 246 aa  202  6e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  46.98 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.29 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.85 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  46.52 
 
 		 233 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  45.06 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 234 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  44.87 
 
 		 235 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 234 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 		 233 aa  196  4.0000000000000005e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>