More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0880 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 226 aa  457  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  63.26 
 
 		 221 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  58.8 
 
 		 221 aa  257  1e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  49.54 
 
 		 219 aa  216  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  48.62 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  48.62 
 
 		 218 aa  211  9e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  44.55 
 
 		 222 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  45.91 
 
 		 222 aa  186  2e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 229 aa  142  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 222 aa  142  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 215 aa  135  4e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 223 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  35.92 
 
 		 235 aa  132  3.9999999999999996e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 223 aa  132  5e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.33 
 
 		 228 aa  132  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  35.51 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0382  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0872291 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 227 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 223 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.38 
 
 		 224 aa  128  8.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 222 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 243 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  34.5 
 
 		 220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 241 aa  126  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 241 aa  125  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.47 
 
 		 236 aa  125  6e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 244 aa  124  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  35.92 
 
 		 221 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 242 aa  122  3e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  123  3e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 244 aa  123  3e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  33.96 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.47 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 233 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0570  phosphate uptake regulator, PhoU  38.69 
 
 		 269 aa  122  4e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.977636  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  34.47 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  34.42 
 
 		 236 aa  122  4e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  31.75 
 
 		 238 aa  122  4e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  33.02 
 
 		 236 aa  122  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  31.75 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  31.75 
 
 		 240 aa  122  5e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  32.08 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 219 aa  121  8e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.21 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.68 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  31.6 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.21 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 253 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 		 233 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1138  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.342387  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.21 
 
 		 253 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  33.02 
 
 		 231 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  33.18 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.97 
 
 		 216 aa  119  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  34.74 
 
 		 242 aa  118  6e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 256 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.97 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 242 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  31.07 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  31.07 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.64 
 
 		 247 aa  117  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 216 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 231 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>