More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_1307 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 235 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  84.42 
 
 		 236 aa  400  1e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  76.86 
 
 		 240 aa  361  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  76.86 
 
 		 240 aa  361  5.0000000000000005e-99  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  51.09 
 
 		 238 aa  217  1e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 243 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  48.9 
 
 		 233 aa  200  9.999999999999999e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  44.68 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  41.13 
 
 		 234 aa  198  7e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  48.2 
 
 		 231 aa  197  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.7 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.7 
 
 		 240 aa  197  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 		 240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.49 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  44.49 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  43.83 
 
 		 237 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  43.53 
 
 		 256 aa  195  6e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  44.74 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  43.4 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  44.93 
 
 		 238 aa  193  2e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  44.25 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  45.18 
 
 		 240 aa  193  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 		 239 aa  192  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  44.84 
 
 		 229 aa  192  5e-48  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.61 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  43.61 
 
 		 238 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  44.49 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 242 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  43.86 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 241 aa  188  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  42.79 
 
 		 242 aa  187  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  45.58 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  43.04 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.44 
 
 		 240 aa  186  3e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  41.48 
 
 		 242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  43.97 
 
 		 237 aa  182  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  44.21 
 
 		 239 aa  181  7e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  43.17 
 
 		 236 aa  179  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  44.39 
 
 		 243 aa  178  4.999999999999999e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  42.17 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  46.12 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  43.48 
 
 		 240 aa  176  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  44.8 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 236 aa  175  6e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  43.3 
 
 		 228 aa  153  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  39.34 
 
 		 227 aa  151  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 		 229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  39.46 
 
 		 233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  39.46 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  39.01 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 231 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  36.7 
 
 		 240 aa  144  1e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.16 
 
 		 228 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 233 aa  135  5e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  37.96 
 
 		 223 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 224 aa  134  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 216 aa  134  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  34.7 
 
 		 233 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 237 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 237 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  35.78 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  35.92 
 
 		 226 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 215 aa  132  5e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 		 236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  34.7 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  32.11 
 
 		 241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  36.11 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  34.88 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2405  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 223 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 		 222 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  32.26 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  32.26 
 
 		 240 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  31.8 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 234 aa  129  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 234 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1701  transcriptional regulator PhoU  34.4 
 
 		 233 aa  128  8.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.892682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 233 aa  128  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  34.67 
 
 		 229 aa  128  9.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  31.65 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 233 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  34.86 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  35.78 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>