More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0780 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 238 aa  489  1e-137  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  96.22 
 
 		 238 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  93.7 
 
 		 238 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  91.18 
 
 		 239 aa  458  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  85.71 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  86.97 
 
 		 238 aa  434  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  86.13 
 
 		 238 aa  432  1e-120  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  61.7 
 
 		 242 aa  305  5.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  60.52 
 
 		 239 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  58.97 
 
 		 237 aa  300  1e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  58.55 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  60.09 
 
 		 240 aa  297  8e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  58.55 
 
 		 237 aa  297  8e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  58.33 
 
 		 239 aa  281  7.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  58.26 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.64 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.64 
 
 		 240 aa  273  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.52 
 
 		 235 aa  270  1e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  56.77 
 
 		 240 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  57.27 
 
 		 237 aa  265  2.9999999999999995e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  56.83 
 
 		 237 aa  264  8e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  55.9 
 
 		 242 aa  258  7e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  53.25 
 
 		 243 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  54.26 
 
 		 236 aa  251  8.000000000000001e-66  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  51.69 
 
 		 238 aa  248  8e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  53.98 
 
 		 243 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  51.97 
 
 		 240 aa  237  1e-61  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  51.1 
 
 		 229 aa  229  4e-59  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  50.88 
 
 		 234 aa  225  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  47.86 
 
 		 239 aa  224  9e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 		 234 aa  206  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  45.69 
 
 		 233 aa  199  5e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  45.18 
 
 		 231 aa  195  6e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  49.11 
 
 		 228 aa  189  2.9999999999999997e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 		 240 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.93 
 
 		 236 aa  185  6e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  44.1 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  44.1 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 232 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  43.42 
 
 		 237 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  45.26 
 
 		 236 aa  181  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  43.56 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  43.56 
 
 		 241 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  43.56 
 
 		 242 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  43.17 
 
 		 236 aa  177  9e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 		 227 aa  176  3e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  43.61 
 
 		 236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  39.74 
 
 		 256 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  42.15 
 
 		 231 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  43.35 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  43.3 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  41.07 
 
 		 229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.09 
 
 		 228 aa  165  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  41.63 
 
 		 224 aa  165  5e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  41.31 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  40.45 
 
 		 235 aa  161  7e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  41.1 
 
 		 223 aa  161  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  39.01 
 
 		 229 aa  161  9e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.59 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  37.5 
 
 		 253 aa  159  3e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 256 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  39.62 
 
 		 256 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 256 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.57 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  39.62 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  40.09 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 239 aa  155  8e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  41.1 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  39.44 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  40.37 
 
 		 233 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 253 aa  153  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  41.12 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  39.72 
 
 		 230 aa  152  4e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 234 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 237 aa  151  8e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 219 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 		 240 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 		 241 aa  149  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  35.47 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  35.47 
 
 		 240 aa  148  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  35.47 
 
 		 238 aa  148  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.45 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  39.71 
 
 		 219 aa  148  8e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.81 
 
 		 243 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  38.77 
 
 		 227 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  36.45 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  36.45 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  36.92 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>