More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2142 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 
240 aa  487  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  98.33 
 
 
240 aa  482  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  73.82 
 
 
242 aa  369  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  71.31 
 
 
237 aa  338  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  68.97 
 
 
237 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  68.53 
 
 
237 aa  334  7.999999999999999e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  68.1 
 
 
235 aa  330  8e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  64.29 
 
 
240 aa  323  2e-87  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  60.7 
 
 
242 aa  289  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  57.78 
 
 
234 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  60.35 
 
 
239 aa  279  3e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  57.08 
 
 
239 aa  276  2e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  59.47 
 
 
240 aa  275  4e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  58.33 
 
 
237 aa  273  1.0000000000000001e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  57.64 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  56.77 
 
 
238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  58.77 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  58.77 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  56.77 
 
 
238 aa  272  3e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  56.52 
 
 
239 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  56.77 
 
 
238 aa  269  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  55.9 
 
 
238 aa  269  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  54.15 
 
 
238 aa  265  4e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  59.82 
 
 
243 aa  261  8e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  54.71 
 
 
236 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  53.33 
 
 
243 aa  241  6e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  53.85 
 
 
238 aa  240  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  48.46 
 
 
229 aa  221  8e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  46.55 
 
 
239 aa  204  8e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 
235 aa  197  9e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  48.47 
 
 
236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.49 
 
 
236 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  48.44 
 
 
232 aa  190  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 
240 aa  190  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  44.34 
 
 
231 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  44.81 
 
 
242 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  45.95 
 
 
233 aa  189  5e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  43.78 
 
 
240 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  43.78 
 
 
240 aa  186  4e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  40.6 
 
 
234 aa  184  9e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  44.78 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  44.78 
 
 
241 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  44.05 
 
 
236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  40.35 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  43.69 
 
 
228 aa  181  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  44.44 
 
 
237 aa  179  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  44 
 
 
233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  43.95 
 
 
236 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  41.48 
 
 
230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  41.98 
 
 
237 aa  172  5.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  43.11 
 
 
233 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  43.11 
 
 
233 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  41.12 
 
 
227 aa  166  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  43.52 
 
 
231 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  40.74 
 
 
229 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 
240 aa  158  7e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 
229 aa  154  9e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 
235 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  42.66 
 
 
233 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.28 
 
 
228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 
239 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 
217 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  38.32 
 
 
241 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  41.59 
 
 
224 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  38.32 
 
 
240 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  38.32 
 
 
240 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
223 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
223 aa  149  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  38.32 
 
 
238 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  40.83 
 
 
234 aa  148  6e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
237 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
233 aa  148  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  39.72 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.25 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 
217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  41.7 
 
 
235 aa  147  1.0000000000000001e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
241 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  40.37 
 
 
234 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
233 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 
234 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  36.93 
 
 
253 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  36.41 
 
 
233 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  36.92 
 
 
235 aa  146  3e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
244 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  42.01 
 
 
234 aa  146  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 
233 aa  145  4.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 
242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
233 aa  146  4.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
244 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  37.85 
 
 
242 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 
220 aa  144  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.25 
 
 
247 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>