More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1542 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 234 aa  480  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  48.93 
 
 		 238 aa  233  3e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  45.78 
 
 		 243 aa  217  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  43.97 
 
 		 239 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  45.53 
 
 		 238 aa  210  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  45.65 
 
 		 238 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 		 238 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  46.09 
 
 		 239 aa  205  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 		 238 aa  205  5e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  45.25 
 
 		 231 aa  204  7e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  46.09 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  44.35 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  42.73 
 
 		 229 aa  198  7e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  41.13 
 
 		 235 aa  198  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  44.69 
 
 		 233 aa  197  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 		 232 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  41.03 
 
 		 242 aa  194  1e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  40.77 
 
 		 242 aa  192  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  43.11 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  42.11 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  41.99 
 
 		 236 aa  189  2.9999999999999997e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.28 
 
 		 236 aa  189  4e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  40.69 
 
 		 256 aa  188  8e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 241 aa  186  2e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  40.52 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.6 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.6 
 
 		 240 aa  184  9e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  40.17 
 
 		 240 aa  183  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 243 aa  182  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  41.96 
 
 		 236 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  40.26 
 
 		 237 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 239 aa  181  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 237 aa  181  1e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  39.47 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  39.47 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.13 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 237 aa  176  3e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 240 aa  175  5e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  39.06 
 
 		 242 aa  171  7.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  40.69 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.96 
 
 		 235 aa  171  1e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.86 
 
 		 240 aa  168  7e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  37.89 
 
 		 237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  36.68 
 
 		 229 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  38.67 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.04 
 
 		 237 aa  158  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  36.41 
 
 		 234 aa  157  1e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  40.47 
 
 		 237 aa  157  1e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  42.41 
 
 		 228 aa  157  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  39.21 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 229 aa  155  5.0000000000000005e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  36 
 
 		 231 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  38.22 
 
 		 234 aa  154  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  37.39 
 
 		 233 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  39.45 
 
 		 233 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 234 aa  151  7e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.74 
 
 		 256 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 233 aa  150  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 		 242 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  38.5 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  38.03 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.62 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.62 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.15 
 
 		 247 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  35.62 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  35.14 
 
 		 237 aa  149  5e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.51 
 
 		 228 aa  148  6e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  36.45 
 
 		 222 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  35.4 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  35.21 
 
 		 238 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  37.96 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  39.53 
 
 		 227 aa  146  3e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  35.21 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  35.21 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  35.05 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  35.51 
 
 		 236 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.87 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 233 aa  145  6e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  34.58 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.4 
 
 		 253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.51 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 233 aa  144  1e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>