More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0822 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 240 aa  483  1e-135  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  64.32 
 
 		 232 aa  273  1.0000000000000001e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  58.04 
 
 		 228 aa  258  5.0000000000000005e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  45.3 
 
 		 243 aa  218  7e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  45.49 
 
 		 239 aa  208  7e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  47.21 
 
 		 238 aa  202  3e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  47.11 
 
 		 240 aa  201  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  47.47 
 
 		 239 aa  201  8e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  47.96 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  47.96 
 
 		 241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.13 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  48.13 
 
 		 237 aa  198  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  47.51 
 
 		 242 aa  198  7e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  46.29 
 
 		 237 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  49.1 
 
 		 243 aa  196  2.0000000000000003e-49  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  45.74 
 
 		 229 aa  194  8.000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 		 239 aa  193  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  46.15 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  45.37 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  44.83 
 
 		 238 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  46.88 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  44.8 
 
 		 231 aa  192  6e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 233 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  42.67 
 
 		 242 aa  190  2e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.35 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  44.4 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  45.26 
 
 		 239 aa  190  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.35 
 
 		 240 aa  190  2e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  44.64 
 
 		 238 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 		 242 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  44.2 
 
 		 238 aa  185  5e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  45.21 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  41.08 
 
 		 237 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.26 
 
 		 235 aa  181  7e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  41.77 
 
 		 237 aa  179  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  41.35 
 
 		 237 aa  178  5.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  42.31 
 
 		 237 aa  178  7e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  43.48 
 
 		 235 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 234 aa  175  6e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  41.18 
 
 		 256 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.46 
 
 		 236 aa  172  3.9999999999999995e-42  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 		 229 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  41.33 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  41.33 
 
 		 240 aa  166  2e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  43.93 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.85 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.46 
 
 		 240 aa  160  2e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  41.15 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37 
 
 		 228 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 		 224 aa  156  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 		 223 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 240 aa  155  5.0000000000000005e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  37.82 
 
 		 243 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  39.27 
 
 		 233 aa  152  4e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 223 aa  151  7e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  37.39 
 
 		 243 aa  150  1e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  37.27 
 
 		 235 aa  151  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  38.25 
 
 		 241 aa  150  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 223 aa  151  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  39.74 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  38.89 
 
 		 237 aa  149  3e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 222 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  39.3 
 
 		 233 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  37.96 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  36.4 
 
 		 244 aa  149  4e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  37.96 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  37.96 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  39.07 
 
 		 235 aa  148  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  36.73 
 
 		 234 aa  148  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 227 aa  148  8e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  37.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  37.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  37.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 244 aa  146  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  37.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  37.79 
 
 		 241 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  38.94 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  38.14 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  36.15 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  7.0000000000000006e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  144  9e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0265  phosphate uptake regulator, PhoU  37.38 
 
 		 237 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.953672  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 217 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.3 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 242 aa  143  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>