More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0011 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
242 aa  491  9.999999999999999e-139  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  73.82 
 
 
240 aa  371  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  73.82 
 
 
240 aa  369  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  73.82 
 
 
240 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  65.38 
 
 
237 aa  323  1e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  64.53 
 
 
237 aa  321  7e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  66.81 
 
 
237 aa  319  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  66.08 
 
 
235 aa  317  1e-85  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  62.07 
 
 
240 aa  307  1.0000000000000001e-82  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  59.4 
 
 
242 aa  290  1e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  58.05 
 
 
239 aa  278  8e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  57.38 
 
 
240 aa  271  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  56.84 
 
 
237 aa  270  2e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.02 
 
 
237 aa  268  4e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  57.02 
 
 
237 aa  268  4e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  57.52 
 
 
239 aa  265  4e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  54.11 
 
 
234 aa  263  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  56.33 
 
 
238 aa  262  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  55.9 
 
 
238 aa  261  6e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  55.9 
 
 
238 aa  258  7e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  55.46 
 
 
238 aa  258  8e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  55.9 
 
 
238 aa  257  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  54.78 
 
 
239 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  58.04 
 
 
243 aa  254  7e-67  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  54.59 
 
 
238 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  55.26 
 
 
238 aa  239  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  52.23 
 
 
236 aa  232  4.0000000000000004e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  51.11 
 
 
243 aa  231  1e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 
239 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  47.09 
 
 
229 aa  205  6e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  46.55 
 
 
236 aa  193  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.93 
 
 
236 aa  190  2e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  42.79 
 
 
235 aa  187  1e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  45.45 
 
 
228 aa  187  1e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 
240 aa  186  3e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 
241 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 
241 aa  186  4e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  43.36 
 
 
233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 
256 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  45.22 
 
 
242 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.69 
 
 
236 aa  181  9.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  48.02 
 
 
232 aa  181  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 
240 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  41.74 
 
 
240 aa  178  7e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  44.3 
 
 
237 aa  177  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  44.34 
 
 
237 aa  175  6e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  41.63 
 
 
231 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  39.06 
 
 
234 aa  171  9e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  46.46 
 
 
236 aa  171  1e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  42.19 
 
 
233 aa  166  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  42.15 
 
 
230 aa  164  8e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  41.35 
 
 
233 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  40.89 
 
 
229 aa  160  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  41.59 
 
 
233 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  41.04 
 
 
240 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  41.33 
 
 
229 aa  156  2e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40.74 
 
 
231 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 
239 aa  153  2e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.12 
 
 
247 aa  151  7e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.63 
 
 
242 aa  151  8e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  37.61 
 
 
227 aa  150  2e-35  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.96 
 
 
228 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  38.25 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  38.71 
 
 
242 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 
233 aa  146  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  38.25 
 
 
242 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  37.21 
 
 
241 aa  146  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.79 
 
 
256 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 
216 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  37.79 
 
 
256 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  37.79 
 
 
256 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 
235 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  40.79 
 
 
239 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  39.9 
 
 
217 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  37.12 
 
 
253 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
243 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  37.21 
 
 
244 aa  142  3e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
241 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
241 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
241 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
241 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
241 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
240 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
219 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
240 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
238 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 
220 aa  142  5e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  37.72 
 
 
253 aa  142  5e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  37.79 
 
 
235 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  37.9 
 
 
235 aa  141  7e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.25 
 
 
232 aa  141  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 
215 aa  141  9e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  36.68 
 
 
253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  36.28 
 
 
242 aa  140  9.999999999999999e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 
235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  39.25 
 
 
232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  36.74 
 
 
244 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 
217 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  36.28 
 
 
243 aa  139  3e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  35.29 
 
 
225 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>