More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0123 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 237 aa  481  1e-135  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  82.28 
 
 		 237 aa  410  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  82.28 
 
 		 237 aa  411  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  83.48 
 
 		 235 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  71.31 
 
 		 240 aa  338  5e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  71.31 
 
 		 240 aa  338  5e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  69.62 
 
 		 240 aa  333  2e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  66.81 
 
 		 242 aa  319  3e-86  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  61.95 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  58.37 
 
 		 240 aa  283  1.0000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  58.72 
 
 		 238 aa  281  9e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  58.26 
 
 		 238 aa  278  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  56.9 
 
 		 237 aa  276  2e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  56.64 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  58.26 
 
 		 238 aa  275  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  56.64 
 
 		 237 aa  275  6e-73  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  58.26 
 
 		 239 aa  274  7e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  56.96 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  57.96 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  57.39 
 
 		 238 aa  273  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  57.71 
 
 		 239 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  57.39 
 
 		 238 aa  272  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  57.96 
 
 		 240 aa  268  5e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  57.52 
 
 		 234 aa  268  5e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  56.5 
 
 		 243 aa  248  4e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  54.5 
 
 		 236 aa  241  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  52.4 
 
 		 238 aa  230  2e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  48.95 
 
 		 243 aa  224  1e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 		 239 aa  215  5e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 229 aa  209  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  45.8 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.8 
 
 		 241 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  45.38 
 
 		 242 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  46.75 
 
 		 236 aa  201  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  46.02 
 
 		 236 aa  200  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  44.68 
 
 		 235 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  45.22 
 
 		 237 aa  198  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.16 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 236 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  42.79 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  42.79 
 
 		 240 aa  180  1e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  45.3 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  42.31 
 
 		 240 aa  178  7e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  40.97 
 
 		 233 aa  174  9e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  41.26 
 
 		 231 aa  174  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  44.39 
 
 		 228 aa  169  3e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  42.67 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  41.07 
 
 		 230 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  41.12 
 
 		 229 aa  161  1e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  42.22 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 		 231 aa  158  6e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.04 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  42.58 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 		 240 aa  155  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 		 227 aa  154  9e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  38.36 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  39.62 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  38.91 
 
 		 235 aa  150  1e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 235 aa  150  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 238 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  38.5 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 244 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  38.68 
 
 		 241 aa  150  2e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 240 aa  150  2e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.05 
 
 		 232 aa  149  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1289  phosphate uptake regulator, PhoU  40.55 
 
 		 233 aa  149  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.498595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.62 
 
 		 247 aa  148  7e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  39.15 
 
 		 244 aa  148  9e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 242 aa  148  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  39.63 
 
 		 253 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  41.4 
 
 		 237 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  37.68 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  37.5 
 
 		 242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  39.55 
 
 		 235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  39.63 
 
 		 253 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  38.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  38.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  37.74 
 
 		 233 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  38.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  38.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  38.21 
 
 		 241 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  37.5 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.12 
 
 		 228 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  37.9 
 
 		 235 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  39.45 
 
 		 233 aa  145  5e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 256 aa  145  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 239 aa  144  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 256 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 234 aa  144  1e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>