More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3576 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  456  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  64.32 
 
 		 240 aa  300  1e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  56.56 
 
 		 228 aa  249  3e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 243 aa  231  5e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  53.1 
 
 		 238 aa  221  9.999999999999999e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 		 239 aa  217  1e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 231 aa  214  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  48.43 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  47.14 
 
 		 234 aa  209  2e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  49.34 
 
 		 243 aa  210  2e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  48.43 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.43 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 		 239 aa  204  9e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  48.21 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.44 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  45.33 
 
 		 239 aa  202  5e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.44 
 
 		 240 aa  202  5e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  45.78 
 
 		 240 aa  201  7e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  48 
 
 		 240 aa  201  8e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  48.46 
 
 		 238 aa  200  9.999999999999999e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  48.02 
 
 		 238 aa  201  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  48.9 
 
 		 238 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  49.31 
 
 		 242 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  48.02 
 
 		 239 aa  198  6e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  46.7 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  46.26 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  46.08 
 
 		 242 aa  196  2.0000000000000003e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  47.35 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  45.3 
 
 		 237 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  48.02 
 
 		 242 aa  195  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 236 aa  195  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  46.88 
 
 		 237 aa  194  8.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.98 
 
 		 235 aa  193  2e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  48.68 
 
 		 236 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  46.88 
 
 		 237 aa  193  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  46.09 
 
 		 236 aa  192  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  45.5 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  46.12 
 
 		 235 aa  192  4e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  46.09 
 
 		 237 aa  192  4e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  47.69 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  47.69 
 
 		 240 aa  185  5e-46  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 236 aa  181  9.000000000000001e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.64 
 
 		 240 aa  177  1e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  42.24 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  44.44 
 
 		 236 aa  175  5e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  43.5 
 
 		 234 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.77 
 
 		 228 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 		 223 aa  161  8.000000000000001e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  41.12 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 217 aa  159  5e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.21 
 
 		 215 aa  158  6e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  40.99 
 
 		 227 aa  158  9e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.37 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.37 
 
 		 223 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  41.71 
 
 		 233 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  40.93 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  37.61 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  40.76 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 237 aa  148  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  37.44 
 
 		 241 aa  148  7e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 237 aa  148  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  37.96 
 
 		 234 aa  148  8e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  40.55 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 219 aa  145  5e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  37.33 
 
 		 241 aa  145  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2854  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  37.84 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 229 aa  144  2e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 233 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1270  phosphate uptake regulator, PhoU  36.96 
 
 		 234 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0482464  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  36.12 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 233 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  35.56 
 
 		 238 aa  142  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.81 
 
 		 243 aa  143  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  35.24 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0886  phosphate uptake regulator, PhoU  37.83 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.257388  normal  0.0383148 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  35.24 
 
 		 240 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  36.89 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  36 
 
 		 244 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  37.27 
 
 		 235 aa  141  8e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  36.24 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>