More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2340 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
239 aa  485  1e-136  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  86.27 
 
 
237 aa  411  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  85.84 
 
 
237 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  85.84 
 
 
237 aa  409  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  80.26 
 
 
239 aa  389  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  80.26 
 
 
240 aa  386  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  59.66 
 
 
242 aa  300  2e-80  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  58.52 
 
 
238 aa  290  1e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  60.68 
 
 
243 aa  290  2e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  58.95 
 
 
238 aa  284  9e-76  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  57.64 
 
 
238 aa  283  2.0000000000000002e-75  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  58.33 
 
 
238 aa  281  7.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  57.02 
 
 
238 aa  281  9e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  57.89 
 
 
239 aa  280  1e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  57.92 
 
 
240 aa  280  2e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  59.73 
 
 
237 aa  278  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  59.73 
 
 
237 aa  279  4e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  57.46 
 
 
238 aa  278  6e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  59.11 
 
 
236 aa  278  6e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.08 
 
 
240 aa  276  2e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.08 
 
 
240 aa  276  2e-73  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  57.71 
 
 
237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  56.33 
 
 
235 aa  272  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  57.52 
 
 
242 aa  265  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  54.7 
 
 
238 aa  258  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  55.31 
 
 
240 aa  243  9.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  51.53 
 
 
229 aa  243  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  51.8 
 
 
243 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  51.97 
 
 
234 aa  231  7.000000000000001e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  49.33 
 
 
239 aa  214  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  47.11 
 
 
233 aa  211  7.999999999999999e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  45.95 
 
 
231 aa  207  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  47.58 
 
 
236 aa  205  5e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  45.81 
 
 
237 aa  205  6e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 
236 aa  204  1e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  47.16 
 
 
242 aa  203  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  47.56 
 
 
241 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  47.56 
 
 
241 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 
256 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  46.46 
 
 
236 aa  201  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  45.41 
 
 
240 aa  193  2e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  43.78 
 
 
240 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  43.78 
 
 
240 aa  190  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.22 
 
 
236 aa  188  5e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  46.79 
 
 
228 aa  188  5.999999999999999e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  47.77 
 
 
232 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  45.58 
 
 
235 aa  186  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  45.21 
 
 
227 aa  186  4e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 
234 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  41.81 
 
 
233 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  44.13 
 
 
237 aa  171  9e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  41.38 
 
 
233 aa  170  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  40.95 
 
 
233 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  40.57 
 
 
253 aa  161  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  40.09 
 
 
253 aa  161  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.39 
 
 
256 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 
240 aa  160  2e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 
256 aa  159  3e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  39.15 
 
 
256 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 
256 aa  159  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.07 
 
 
242 aa  158  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 
253 aa  157  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  38.29 
 
 
229 aa  157  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 
231 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  41.2 
 
 
222 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 
239 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  39.07 
 
 
242 aa  157  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  38.6 
 
 
242 aa  155  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.22 
 
 
228 aa  155  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 
230 aa  155  6e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
216 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 
235 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 
233 aa  154  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 
219 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 
217 aa  152  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.68 
 
 
247 aa  151  8e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  39.91 
 
 
234 aa  151  8.999999999999999e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 
234 aa  150  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  39.42 
 
 
219 aa  149  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2630  phosphate uptake regulator, PhoU  39.45 
 
 
233 aa  149  4e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608204  normal  0.109033 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4914  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 
233 aa  149  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24576 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 
217 aa  148  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  35.47 
 
 
241 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.18 
 
 
224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  37.96 
 
 
220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  38.99 
 
 
235 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 
235 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 
233 aa  146  3e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 
215 aa  145  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 
234 aa  145  5e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  36.49 
 
 
243 aa  145  6e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.38 
 
 
234 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  36.49 
 
 
240 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.96 
 
 
232 aa  144  9e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  36.49 
 
 
238 aa  144  9e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  36.49 
 
 
240 aa  144  9e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 
237 aa  144  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  36.04 
 
 
244 aa  144  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  39.17 
 
 
233 aa  144  1e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 
223 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>