More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_0488 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 		 235 aa  479  1e-134  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  83.48 
 
 		 237 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  83.12 
 
 		 237 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  82.25 
 
 		 237 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  68.1 
 
 		 240 aa  330  8e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  68.1 
 
 		 240 aa  330  8e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  66.81 
 
 		 240 aa  327  1.0000000000000001e-88  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  66.08 
 
 		 242 aa  317  1e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  59.57 
 
 		 242 aa  291  5e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  57.08 
 
 		 240 aa  281  5.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  55.98 
 
 		 239 aa  274  7e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  57.08 
 
 		 238 aa  272  3e-72  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  56.33 
 
 		 239 aa  272  3e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  54.39 
 
 		 237 aa  271  7e-72  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  57.52 
 
 		 238 aa  270  1e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  53.95 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  53.95 
 
 		 237 aa  269  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  56.64 
 
 		 238 aa  269  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  57.46 
 
 		 234 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  56.64 
 
 		 238 aa  268  5.9999999999999995e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  55.13 
 
 		 240 aa  268  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  56.44 
 
 		 238 aa  267  1e-70  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  56.19 
 
 		 239 aa  264  7e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  56 
 
 		 238 aa  263  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  54.47 
 
 		 238 aa  243  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  52.89 
 
 		 243 aa  242  3e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  50.22 
 
 		 236 aa  231  1e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  50.65 
 
 		 243 aa  228  5e-59  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  46.88 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  44.98 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  45.26 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  44.83 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  44.83 
 
 		 241 aa  196  4.0000000000000005e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  45.06 
 
 		 236 aa  195  6e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  44.02 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  42.04 
 
 		 256 aa  192  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  43.61 
 
 		 235 aa  191  7e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  43.48 
 
 		 236 aa  191  1e-47  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  41.7 
 
 		 237 aa  190  1e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  45.26 
 
 		 240 aa  181  7e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  41.99 
 
 		 236 aa  181  7e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  42.54 
 
 		 233 aa  181  1e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  46.85 
 
 		 228 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  41.44 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  46.98 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  40.43 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  40.43 
 
 		 240 aa  171  6.999999999999999e-42  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  38.96 
 
 		 234 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  41.23 
 
 		 233 aa  165  4e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  40.79 
 
 		 233 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  40.79 
 
 		 233 aa  162  5.0000000000000005e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 		 230 aa  161  9e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40.27 
 
 		 231 aa  161  9e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  40.47 
 
 		 227 aa  160  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  40.18 
 
 		 229 aa  159  3e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  42.11 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 229 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 240 aa  150  1e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  37.38 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 219 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  37.67 
 
 		 253 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.67 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2810  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 234 aa  145  5e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 242 aa  145  6e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 215 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  37.67 
 
 		 253 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 216 aa  145  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  35.35 
 
 		 243 aa  144  8.000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.81 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1276  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.382015 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  35.35 
 
 		 244 aa  143  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  35.81 
 
 		 235 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 256 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  35.35 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 256 aa  143  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.62 
 
 		 232 aa  143  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 256 aa  142  3e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1658  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 235 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.764338 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  36.12 
 
 		 232 aa  142  4e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  34.88 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  34.88 
 
 		 238 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  35.35 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  38.18 
 
 		 234 aa  142  5e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 235 aa  142  5e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  34.88 
 
 		 240 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.98 
 
 		 228 aa  142  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2202  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 		 234 aa  141  7e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.246879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 253 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 233 aa  141  8e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  35 
 
 		 225 aa  140  1.9999999999999998e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  34.88 
 
 		 243 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 239 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 		 224 aa  139  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  38.03 
 
 		 235 aa  139  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  33.49 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 233 aa  138  6e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  34.42 
 
 		 244 aa  138  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>