More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1258 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 241 aa  486  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  97.42 
 
 		 242 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  70.82 
 
 		 236 aa  339  2e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  73.25 
 
 		 236 aa  338  5.9999999999999996e-92  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  71.24 
 
 		 237 aa  333  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  65.33 
 
 		 236 aa  302  3.0000000000000004e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  50 
 
 		 243 aa  221  6e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  49.78 
 
 		 238 aa  214  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  45.8 
 
 		 237 aa  204  9e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  46.64 
 
 		 237 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  46.64 
 
 		 237 aa  203  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  47.56 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  46.64 
 
 		 237 aa  202  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  46.22 
 
 		 237 aa  202  5e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  46.64 
 
 		 240 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  46.29 
 
 		 229 aa  200  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  47.96 
 
 		 240 aa  200  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  45.58 
 
 		 239 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  45.37 
 
 		 239 aa  196  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.83 
 
 		 235 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  46.19 
 
 		 243 aa  191  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  44.93 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  44.93 
 
 		 240 aa  191  1e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 235 aa  188  5e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 		 242 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  42.11 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  43.69 
 
 		 236 aa  187  1e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  43.91 
 
 		 238 aa  186  3e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  45.61 
 
 		 242 aa  186  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  44.78 
 
 		 240 aa  185  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.78 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.78 
 
 		 240 aa  184  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  44.74 
 
 		 236 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  44.35 
 
 		 238 aa  182  6e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  44.1 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  43.04 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  43.56 
 
 		 238 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  43.23 
 
 		 238 aa  178  8e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  43.23 
 
 		 238 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 232 aa  177  9e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  40.97 
 
 		 231 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  44.69 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  42.31 
 
 		 240 aa  172  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  41.05 
 
 		 233 aa  172  5e-42  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.48 
 
 		 240 aa  164  9e-40  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.6 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  37.6 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  37.6 
 
 		 256 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 231 aa  161  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 233 aa  161  1e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  40.74 
 
 		 242 aa  160  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  38.97 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  40 
 
 		 237 aa  160  2e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  40.74 
 
 		 242 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  40.74 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  42.53 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  42.53 
 
 		 237 aa  158  6e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.97 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.44 
 
 		 247 aa  157  1e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  39.72 
 
 		 233 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  39.73 
 
 		 235 aa  157  2e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  38.97 
 
 		 253 aa  156  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 233 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 217 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  38.94 
 
 		 233 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  39.38 
 
 		 233 aa  155  4e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  41.89 
 
 		 228 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 		 222 aa  154  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  39.23 
 
 		 215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 235 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  40.38 
 
 		 220 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  37.04 
 
 		 236 aa  152  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  39.73 
 
 		 237 aa  152  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.73 
 
 		 237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  39.44 
 
 		 219 aa  152  7e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  38.99 
 
 		 234 aa  151  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2315  phosphate uptake regulator, PhoU  38.59 
 
 		 233 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  37.18 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  39.19 
 
 		 235 aa  149  3e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  41.55 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  38.64 
 
 		 229 aa  149  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 234 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.61 
 
 		 234 aa  148  6e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2256  phosphate uptake regulator, PhoU  38.59 
 
 		 233 aa  148  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0952502  normal  0.407318 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  36.75 
 
 		 234 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>