More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1415 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 218 aa  445  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  57.8 
 
 		 218 aa  261  8e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  58.18 
 
 		 220 aa  258  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  57.27 
 
 		 219 aa  249  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  48.15 
 
 		 217 aa  201  8e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 234 aa  200  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 217 aa  194  9e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  45.67 
 
 		 243 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  44.5 
 
 		 219 aa  188  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 		 221 aa  176  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 216 aa  176  3e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  41.98 
 
 		 215 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  42.45 
 
 		 238 aa  170  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  40.47 
 
 		 221 aa  168  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.53 
 
 		 221 aa  168  6e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  40.65 
 
 		 221 aa  168  7e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 		 225 aa  167  1e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 		 217 aa  165  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  42.34 
 
 		 218 aa  166  4e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 229 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 		 229 aa  153  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.28 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 237 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  39.52 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  38.71 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  40.51 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 222 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 231 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 239 aa  149  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.41 
 
 		 228 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 242 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  37.14 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 		 242 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 235 aa  144  7.0000000000000006e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  38.6 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 234 aa  144  9e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 240 aa  143  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 241 aa  143  2e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 233 aa  143  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 239 aa  142  3e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 233 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  38.94 
 
 		 242 aa  142  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  38.46 
 
 		 242 aa  142  5e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  38.46 
 
 		 253 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 230 aa  141  7e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 238 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  36.67 
 
 		 242 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.46 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  37.09 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 233 aa  140  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 238 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 256 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  38.03 
 
 		 236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 240 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  35.81 
 
 		 218 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 228 aa  138  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.26 
 
 		 235 aa  138  4.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  35.35 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34.95 
 
 		 227 aa  137  7.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  39.42 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  137  1e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 238 aa  137  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 232 aa  137  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  35.71 
 
 		 238 aa  137  2e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  36.49 
 
 		 236 aa  137  2e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 231 aa  135  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  36.89 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  36.89 
 
 		 238 aa  135  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  38.81 
 
 		 219 aa  135  5e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  35.92 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  35.92 
 
 		 218 aa  135  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  36.89 
 
 		 240 aa  135  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  38.65 
 
 		 236 aa  135  6.0000000000000005e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>