More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_2830 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 220 aa  447  1e-125  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  47.34 
 
 		 216 aa  182  5.0000000000000004e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  42.38 
 
 		 221 aa  178  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  42.11 
 
 		 217 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  42.11 
 
 		 217 aa  167  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  40.58 
 
 		 214 aa  151  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 216 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1962  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  40.19 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  34.88 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.11 
 
 		 219 aa  142  4e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  36.45 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.74 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.44 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  33.83 
 
 		 226 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 233 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1876  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 233 aa  132  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 222 aa  131  6.999999999999999e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 217 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 227 aa  131  1.0000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 219 aa  129  3e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  36.23 
 
 		 224 aa  129  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 230 aa  129  5.0000000000000004e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 234 aa  127  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.78 
 
 		 223 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.12 
 
 		 228 aa  124  8.000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 222 aa  124  9e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.43 
 
 		 232 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  34.01 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 223 aa  122  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 232 aa  122  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  33.49 
 
 		 237 aa  121  7e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 232 aa  121  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 235 aa  120  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 243 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 226 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0041  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.19 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.660859  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  31.9 
 
 		 221 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 224 aa  119  4.9999999999999996e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.95 
 
 		 221 aa  118  6e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 219 aa  118  9e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  35.47 
 
 		 229 aa  117  9.999999999999999e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.92 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  30.29 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 241 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  30.92 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  30.92 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 220 aa  116  3e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  30.92 
 
 		 238 aa  116  3e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  30.92 
 
 		 232 aa  115  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  30.77 
 
 		 244 aa  115  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  29.81 
 
 		 236 aa  115  5e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 216 aa  115  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2181  phosphate uptake regulator PhoU  35.61 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0784096 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  29.33 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  30.43 
 
 		 236 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  30.29 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0579  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  30.43 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 238 aa  113  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  29.47 
 
 		 231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.81 
 
 		 246 aa  113  2.0000000000000002e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1148  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 234 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.0480407 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>