More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4001 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
227 aa  460  1e-129  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  42.38 
 
 
222 aa  159  4e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  40.57 
 
 
220 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.23 
 
 
221 aa  144  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  38.76 
 
 
221 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 
221 aa  142  4e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  39.32 
 
 
219 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.94 
 
 
221 aa  131  9e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 
218 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 
220 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  37.44 
 
 
218 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
219 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 
218 aa  126  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 
220 aa  125  4.0000000000000003e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 
229 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
216 aa  125  5e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1632  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 
229 aa  125  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  36.76 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2739  phosphate uptake regulator PhoU  36.45 
 
 
221 aa  118  7e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0103361  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
215 aa  115  5e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
218 aa  115  6e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
217 aa  115  6e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  30.63 
 
 
240 aa  115  6.9999999999999995e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2550  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3556  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 
222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 
216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 
217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3602  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 
222 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00648166 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3367  phosphate uptake regulator, PhoU  34.98 
 
 
222 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 
226 aa  112  6e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1604  phosphate uptake regulator, PhoU  35.6 
 
 
225 aa  112  6e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  33.16 
 
 
215 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  36.07 
 
 
220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.18 
 
 
228 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
225 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 
226 aa  108  5e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1446  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1475  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.33 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.632881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
223 aa  107  1e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 
221 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
223 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  31.55 
 
 
243 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
223 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  31.56 
 
 
236 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 
223 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0031  phosphate uptake regulator, PhoU  36.32 
 
 
219 aa  105  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.320331  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  32.46 
 
 
232 aa  105  4e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 
239 aa  105  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 
240 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
218 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 
219 aa  105  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
224 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 
232 aa  105  6e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 
242 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 
236 aa  105  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.77 
 
 
224 aa  105  7e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  29.82 
 
 
226 aa  105  7e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 
219 aa  105  8e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 
241 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
234 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 
241 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 
223 aa  104  1e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 
216 aa  102  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2448  phosphate transport system protein PhoU  30.84 
 
 
242 aa  102  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.71201  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 
226 aa  102  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 
217 aa  102  5e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  31.65 
 
 
237 aa  102  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
238 aa  101  8e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
236 aa  101  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.65 
 
 
237 aa  101  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 
237 aa  100  1e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 
237 aa  101  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 
240 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.11 
 
 
239 aa  100  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0585  phosphate uptake regulator, PhoU  36.04 
 
 
214 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.504755 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.16 
 
 
236 aa  99.8  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  29.3 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4447  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 
234 aa  99.8  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 
218 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 
239 aa  99.8  3e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 
238 aa  99.8  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
216 aa  99.4  4e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03148  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.86 
 
 
246 aa  99.4  4e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.326262  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  30.05 
 
 
218 aa  99.4  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 
229 aa  99  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  31.22 
 
 
234 aa  99.4  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
222 aa  99  6e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
240 aa  98.6  6e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  29.07 
 
 
240 aa  99  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 
220 aa  98.6  8e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  31.07 
 
 
235 aa  98.6  8e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
246 aa  98.2  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.7 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 
227 aa  97.1  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.7 
 
 
240 aa  97.1  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 
222 aa  97.1  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.55 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.55 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.55 
 
 
234 aa  96.7  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>