More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1560 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 232 aa  462  1e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  96.12 
 
 		 232 aa  447  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  51.82 
 
 		 220 aa  238  9e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  52.29 
 
 		 216 aa  221  7e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1432  phosphate uptake regulator, PhoU  43.72 
 
 		 215 aa  191  7e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 		 217 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 220 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 216 aa  121  9e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  34.42 
 
 		 220 aa  119  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.59 
 
 		 236 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  32.62 
 
 		 239 aa  118  7e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 216 aa  118  7.999999999999999e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  32.39 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 221 aa  115  6e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 226 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.81 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 		 225 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.11 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 256 aa  112  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  31.31 
 
 		 218 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  33.64 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 217 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  33.18 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  28.26 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  29.22 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  29.49 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 229 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.49 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.49 
 
 		 247 aa  109  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  29.38 
 
 		 243 aa  109  4.0000000000000004e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 218 aa  109  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  28.44 
 
 		 239 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  32.77 
 
 		 253 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  32.34 
 
 		 253 aa  108  8.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  31.78 
 
 		 235 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 242 aa  106  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  31.63 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.52 
 
 		 232 aa  105  5e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  30.91 
 
 		 229 aa  105  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 241 aa  105  6e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 227 aa  105  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 230 aa  104  1e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.75 
 
 		 226 aa  103  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  30.91 
 
 		 237 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 221 aa  103  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  28.84 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.42 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.57 
 
 		 217 aa  103  3e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.15 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  28.84 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  28.84 
 
 		 240 aa  103  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  102  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  29.25 
 
 		 222 aa  102  5e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 		 238 aa  102  7e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  31.51 
 
 		 237 aa  101  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 238 aa  101  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 236 aa  101  8e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2659  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 222 aa  101  9e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 238 aa  101  9e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  28.24 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 		 218 aa  101  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0880  phosphate uptake regulator, PhoU  28.12 
 
 		 226 aa  100  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0701467 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  28.3 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  27.78 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 		 231 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  100  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  29.44 
 
 		 238 aa  100  3e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  99.8  3e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  27.91 
 
 		 241 aa  100  3e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>