More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1825 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 216 aa  420  1e-117  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  54.13 
 
 		 232 aa  231  7.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  52.29 
 
 		 232 aa  226  3e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  52.05 
 
 		 220 aa  207  7e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1432  phosphate uptake regulator, PhoU  50.95 
 
 		 215 aa  206  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.58 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.51 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 217 aa  104  8e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  31.03 
 
 		 239 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 234 aa  102  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 238 aa  101  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  32.38 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 239 aa  100  2e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.39 
 
 		 239 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 216 aa  99.8  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  30 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  31.19 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0594  phosphate uptake regulator, PhoU  32.21 
 
 		 224 aa  99.4  3e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  30.85 
 
 		 237 aa  99  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  31.19 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.85 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 253 aa  99  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.85 
 
 		 237 aa  99  5e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 256 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  29.55 
 
 		 244 aa  98.2  8e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.19 
 
 		 256 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 		 230 aa  98.2  8e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 256 aa  98.2  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 215 aa  97.8  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 256 aa  97.4  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  30.41 
 
 		 215 aa  96.7  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  29.95 
 
 		 236 aa  97.1  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  31.5 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  29.9 
 
 		 240 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  29.17 
 
 		 232 aa  97.1  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.29 
 
 		 217 aa  96.7  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 238 aa  96.7  2e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 240 aa  97.4  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  29.55 
 
 		 243 aa  96.3  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3117  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.585921  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  28.91 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  31.68 
 
 		 238 aa  96.3  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  29.55 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  28.91 
 
 		 243 aa  95.5  6e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.03 
 
 		 241 aa  95.1  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.19 
 
 		 247 aa  94.4  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  28.64 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 242 aa  94.4  1e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 		 221 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0956  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  35.43 
 
 		 215 aa  93.6  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  29.82 
 
 		 253 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  93.2  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 218 aa  93.6  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2385  phosphate uptake regulator, PhoU  27.31 
 
 		 221 aa  94  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.041607  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  29.36 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  30.56 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  93.2  3e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 222 aa  92.8  3e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  28.64 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  28.64 
 
 		 238 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 218 aa  93.2  3e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  29.06 
 
 		 229 aa  93.2  3e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  28.64 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  28.64 
 
 		 244 aa  92.8  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  29.68 
 
 		 238 aa  92.4  5e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.32 
 
 		 217 aa  92.4  5e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  26.17 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  29.82 
 
 		 253 aa  92  6e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.03 
 
 		 232 aa  92  6e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 239 aa  92  6e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  29.09 
 
 		 238 aa  92  6e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  31.31 
 
 		 236 aa  92  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  30.62 
 
 		 219 aa  91.7  8e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  31.31 
 
 		 220 aa  91.7  9e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  28.64 
 
 		 239 aa  91.3  9e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  30.84 
 
 		 236 aa  90.9  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  28.57 
 
 		 232 aa  90.5  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  28.24 
 
 		 237 aa  90.1  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 		 232 aa  90.1  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 241 aa  90.1  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 225 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>