More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_0310 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 218 aa  428  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  89.86 
 
 		 218 aa  385  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0031  phosphate uptake regulator, PhoU  46.79 
 
 		 219 aa  176  3e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.320331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  43.78 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  39.81 
 
 		 219 aa  147  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  39.73 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 220 aa  139  3e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  38.07 
 
 		 220 aa  138  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  38.43 
 
 		 217 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 215 aa  134  9e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0585  phosphate uptake regulator, PhoU  41.04 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504755 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 227 aa  131  7.999999999999999e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  35.94 
 
 		 221 aa  128  6e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  36.71 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.02 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 		 221 aa  126  3e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 236 aa  125  7e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 236 aa  124  1e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 229 aa  123  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  32.85 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 217 aa  122  4e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  36.28 
 
 		 239 aa  122  5e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  35.81 
 
 		 223 aa  122  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.62 
 
 		 224 aa  121  8e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.94 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  36.1 
 
 		 224 aa  120  9.999999999999999e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 219 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.81 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 223 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 240 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 236 aa  118  7e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 222 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  35.19 
 
 		 240 aa  117  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.11 
 
 		 228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  37.09 
 
 		 229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.75 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.86 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 237 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 243 aa  115  6e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  35.75 
 
 		 232 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  33.33 
 
 		 241 aa  113  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  33.63 
 
 		 218 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.94 
 
 		 219 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 221 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 239 aa  112  6e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  36.95 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  31.58 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0092  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 246 aa  109  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  35.86 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  33.03 
 
 		 238 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 217 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4153  phosphate uptake regulator, PhoU  36.18 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.429365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  32.85 
 
 		 241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  32.38 
 
 		 243 aa  108  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  34.5 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  35.26 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1632  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 229 aa  108  6e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6883  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  33.01 
 
 		 238 aa  108  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  33.01 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 238 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 239 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 235 aa  107  1e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  32.23 
 
 		 244 aa  107  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  33.01 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 		 242 aa  107  1e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  32.71 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 216 aa  107  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  35.82 
 
 		 237 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  36.45 
 
 		 235 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  33.33 
 
 		 232 aa  105  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  33.83 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  33.83 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  33.83 
 
 		 234 aa  105  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  33.5 
 
 		 236 aa  105  7e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 231 aa  105  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  35.12 
 
 		 233 aa  104  9e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 226 aa  104  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  31.9 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  33.83 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.3 
 
 		 227 aa  104  1e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>