More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0608 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  99.08 
 
 		 217 aa  427  1e-119  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 		 217 aa  430  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  40.2 
 
 		 215 aa  152  5e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  38.19 
 
 		 226 aa  142  5e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.76 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.17 
 
 		 221 aa  134  7.000000000000001e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  37.7 
 
 		 220 aa  134  8e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  39.39 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  36.45 
 
 		 216 aa  133  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  37.7 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  37.68 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  38.1 
 
 		 234 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 221 aa  128  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  35.61 
 
 		 225 aa  125  5e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 229 aa  122  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  33.79 
 
 		 238 aa  122  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  34.36 
 
 		 220 aa  122  5e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 228 aa  122  6e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  32.16 
 
 		 221 aa  121  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  34.31 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 219 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.19 
 
 		 228 aa  119  3e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  32.7 
 
 		 218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.23 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.23 
 
 		 218 aa  118  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.68 
 
 		 243 aa  117  9e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  32.67 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.17 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  34.65 
 
 		 232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 218 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.75 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  33.85 
 
 		 216 aa  116  3e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 239 aa  116  3e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  31.75 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 240 aa  116  3e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 242 aa  115  3.9999999999999997e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34.04 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 		 238 aa  115  6e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 219 aa  115  6e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.75 
 
 		 228 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 237 aa  114  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 231 aa  114  8.999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.67 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 237 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  30.2 
 
 		 239 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.88 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.67 
 
 		 223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 233 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  31.28 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 217 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 		 238 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  33.69 
 
 		 223 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 239 aa  112  3e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 239 aa  113  3e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  34.69 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  32.18 
 
 		 223 aa  113  3e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  33.99 
 
 		 220 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 234 aa  112  4.0000000000000004e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  31.03 
 
 		 238 aa  111  6e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 		 222 aa  112  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  30.1 
 
 		 240 aa  111  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  32.64 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  32.64 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0987  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.26 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.188055  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 237 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  32.18 
 
 		 233 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 242 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  33 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.23 
 
 		 224 aa  109  4.0000000000000004e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  31.88 
 
 		 218 aa  108  5e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  31.37 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.06 
 
 		 240 aa  108  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  31.34 
 
 		 220 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 240 aa  107  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  30.37 
 
 		 216 aa  107  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  32.34 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 237 aa  106  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  31.43 
 
 		 253 aa  106  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  28.22 
 
 		 221 aa  106  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  34.58 
 
 		 237 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  32.67 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  33.85 
 
 		 236 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  28.57 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>