More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0483 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 216 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  50.7 
 
 		 216 aa  224  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1920  phosphate uptake regulator, PhoU  49.07 
 
 		 216 aa  216  2.9999999999999998e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.21 
 
 		 215 aa  159  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.2 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 216 aa  147  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.35 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 243 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  36.59 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  34.6 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  35.07 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 236 aa  139  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 217 aa  138  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.65 
 
 		 221 aa  136  2e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.45 
 
 		 228 aa  137  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 		 223 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  37.86 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.86 
 
 		 237 aa  135  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  37.86 
 
 		 237 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  30.99 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1525  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 230 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.874446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  35.55 
 
 		 219 aa  133  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 240 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  33.97 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 241 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2984  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 234 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 240 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 229 aa  130  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 236 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 220 aa  129  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 223 aa  129  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 216 aa  128  7.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.98 
 
 		 219 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3544  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 256 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.506855  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.92 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 229 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  36.41 
 
 		 228 aa  126  2.0000000000000002e-28  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 242 aa  126  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 234 aa  126  3e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 218 aa  125  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 237 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 238 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 242 aa  124  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 220 aa  124  1e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  37 
 
 		 237 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.09 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 220 aa  123  2e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 238 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 		 239 aa  123  2e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 233 aa  123  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  34.8 
 
 		 240 aa  122  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 218 aa  122  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 226 aa  122  5e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  32.86 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1115  phosphate uptake regulator, PhoU  34.09 
 
 		 218 aa  122  5e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.567371  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 242 aa  122  6e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 		 239 aa  121  7e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 241 aa  121  8e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  32.86 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.31 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  33.49 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.31 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 238 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  31.28 
 
 		 239 aa  120  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  32.39 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 256 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 240 aa  120  9.999999999999999e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  31.46 
 
 		 217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 238 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 227 aa  119  4.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.33 
 
 		 232 aa  118  6e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1307  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 		 235 aa  118  7e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226837 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  32.69 
 
 		 237 aa  118  7.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 230 aa  117  9.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4413  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 236 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210966  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.8 
 
 		 247 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 226 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>