More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_0710 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 218 aa  444  1.0000000000000001e-124  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  61.19 
 
 		 219 aa  285  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  57.8 
 
 		 218 aa  277  7e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  55.71 
 
 		 234 aa  221  7e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  47.27 
 
 		 220 aa  216  2e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  50.93 
 
 		 217 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  50.93 
 
 		 217 aa  207  1e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  46.79 
 
 		 219 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  43.93 
 
 		 221 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  42.92 
 
 		 215 aa  189  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  42.4 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 216 aa  183  2.0000000000000003e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 		 221 aa  179  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.47 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  41.86 
 
 		 217 aa  175  5e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  41.71 
 
 		 243 aa  175  6e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  40.47 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  42.86 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  39.53 
 
 		 238 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  38.14 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  37.33 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 229 aa  155  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  40.27 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  39.9 
 
 		 222 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 		 229 aa  152  2.9999999999999998e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 		 227 aa  150  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 239 aa  149  3e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  38.78 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.84 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.32 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 237 aa  148  7e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  37.32 
 
 		 237 aa  147  9e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  37.98 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 239 aa  145  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  37.8 
 
 		 240 aa  144  8.000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 242 aa  143  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 239 aa  142  4e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 228 aa  142  5e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 223 aa  141  9e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.32 
 
 		 235 aa  140  1.9999999999999998e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  35.75 
 
 		 223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  36.89 
 
 		 227 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  35.85 
 
 		 231 aa  139  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  37.74 
 
 		 243 aa  139  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  35.81 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 219 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3576  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 232 aa  138  6e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.47067 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  35.89 
 
 		 223 aa  138  7e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 218 aa  138  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.81 
 
 		 228 aa  137  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  35.35 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  35.35 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 		 233 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 242 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 		 238 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 240 aa  136  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 231 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 241 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 238 aa  135  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  36.19 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 240 aa  135  4e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1909  phosphate uptake regulator, PhoU  34.95 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.553702  normal  0.247056 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  35.51 
 
 		 234 aa  134  9e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  36.15 
 
 		 236 aa  134  9.999999999999999e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  36.02 
 
 		 231 aa  133  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.02 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  36.02 
 
 		 240 aa  132  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  37.31 
 
 		 215 aa  132  3e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  33.81 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2280  phosphate uptake regulator, PhoU  37.62 
 
 		 228 aa  132  3.9999999999999996e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0285843  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  36.02 
 
 		 242 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  33.95 
 
 		 226 aa  131  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  35.65 
 
 		 216 aa  131  6.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.1 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 237 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.1 
 
 		 217 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  37.26 
 
 		 237 aa  130  2.0000000000000002e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  33.96 
 
 		 238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 		 218 aa  129  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 224 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>