More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1671 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 217 aa  428  1e-119  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  51.64 
 
 		 215 aa  224  9e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  46.54 
 
 		 217 aa  205  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  45.28 
 
 		 216 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  46.54 
 
 		 217 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  44.08 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  43.13 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  47.49 
 
 		 234 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  41.78 
 
 		 220 aa  174  8e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  42.13 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  41.01 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  41.94 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  41.67 
 
 		 218 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  41.47 
 
 		 221 aa  169  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 		 229 aa  169  3e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  40.78 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  41.4 
 
 		 218 aa  165  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  39.29 
 
 		 220 aa  161  8.000000000000001e-39  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  41.54 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  41.54 
 
 		 233 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 216 aa  160  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  38.53 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  42.05 
 
 		 233 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.43 
 
 		 228 aa  156  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  41.79 
 
 		 222 aa  156  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 223 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  38.32 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  35.32 
 
 		 222 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1782  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 226 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  39.35 
 
 		 223 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 218 aa  149  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  38.89 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2996  phosphate uptake regulator, PhoU  36.79 
 
 		 219 aa  148  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  40.67 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  37.21 
 
 		 218 aa  144  8.000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  37.67 
 
 		 243 aa  143  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 226 aa  142  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0903  phosphate uptake regulator, PhoU  38.57 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.656242  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4018  phosphate transport system regulatory protein  35.38 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4348  phosphate transport system regulatory protein PhoU, putative  35.38 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4401  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.38 
 
 		 228 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4008  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.38 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2484  phosphate uptake regulator, PhoU  37.79 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4288  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.38 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0302949 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0909  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 		 226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4170  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.91 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4492  phosphate transporter PhoU  34.91 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  37.14 
 
 		 238 aa  139  3e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4384  putative phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.91 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0489  phosphate uptake regulator, PhoU  36.87 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.762813  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 		 236 aa  138  7.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0852  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.38 
 
 		 218 aa  137  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1787  phosphate uptake regulator, PhoU  38.18 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.276553  normal  0.0287996 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  40 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4121  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  36.63 
 
 		 240 aa  137  2e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 		 240 aa  134  8e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  35.48 
 
 		 224 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  40.31 
 
 		 228 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.25 
 
 		 224 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2279  phosphate uptake regulator, PhoU  36.15 
 
 		 216 aa  132  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1440  phosphate transport system protein PhoU  34.72 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1157  phosphate uptake regulator, PhoU  34.72 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.724725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 		 233 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  36.99 
 
 		 222 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.64 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0608  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.16 
 
 		 217 aa  131  6e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00182216  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 		 219 aa  132  6e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  37.31 
 
 		 239 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 220 aa  131  7.999999999999999e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  35.24 
 
 		 222 aa  131  9e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.16 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00632575  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  37.7 
 
 		 228 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  36.84 
 
 		 234 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 219 aa  130  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  35.64 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 226 aa  129  3e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  35.07 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 231 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  34.74 
 
 		 253 aa  128  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.15 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 237 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  36.2 
 
 		 224 aa  128  6e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  37.63 
 
 		 228 aa  128  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  35.21 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4547  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 		 229 aa  128  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.678112  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  34.74 
 
 		 242 aa  128  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  34.27 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 220 aa  128  8.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  34.27 
 
 		 256 aa  127  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>