More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1042 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
228 aa  455  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  78.07 
 
 
228 aa  362  2e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  77.1 
 
 
219 aa  332  3e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  71.93 
 
 
228 aa  332  3e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  67.54 
 
 
228 aa  308  2.9999999999999997e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  59.21 
 
 
228 aa  278  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  60.53 
 
 
228 aa  277  9e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  56.58 
 
 
232 aa  265  5e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  52.19 
 
 
228 aa  223  2e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  51.56 
 
 
223 aa  215  5e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  43.27 
 
 
215 aa  148  8e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 
215 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  45.45 
 
 
224 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  43.98 
 
 
226 aa  135  4e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  40.31 
 
 
217 aa  133  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  37.02 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 
229 aa  125  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.78 
 
 
228 aa  124  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 
221 aa  122  4e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  36.1 
 
 
234 aa  122  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  34.25 
 
 
222 aa  119  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 
224 aa  119  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  36.63 
 
 
219 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
233 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 
230 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 
223 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 
223 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
232 aa  116  3e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.12 
 
 
226 aa  115  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 
223 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 
238 aa  115  6e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 
222 aa  115  6e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  35 
 
 
217 aa  115  6e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 
223 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.74 
 
 
225 aa  113  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 
226 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 
223 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 
219 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 
216 aa  111  9e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  34.98 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  35.26 
 
 
227 aa  108  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 
253 aa  108  6e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 
217 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
219 aa  108  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  32.51 
 
 
218 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 
218 aa  107  1e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  33.65 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 
256 aa  107  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  32.72 
 
 
242 aa  106  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  34.62 
 
 
217 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  36.36 
 
 
219 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
242 aa  105  8e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  32.69 
 
 
253 aa  104  9e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 
220 aa  103  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
222 aa  104  1e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
256 aa  103  2e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  33.17 
 
 
253 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  32.13 
 
 
240 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  33.97 
 
 
242 aa  103  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  33.66 
 
 
215 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  33.01 
 
 
242 aa  103  3e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  32.88 
 
 
222 aa  103  3e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  31.4 
 
 
224 aa  103  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3442  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
225 aa  102  4e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.27 
 
 
228 aa  102  6e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 
243 aa  102  6e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 
214 aa  102  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30 
 
 
239 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  32.08 
 
 
233 aa  101  8e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
222 aa  101  8e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1928  phosphate uptake regulator, PhoU  32.84 
 
 
220 aa  101  1e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0636497  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
220 aa  101  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.7 
 
 
247 aa  101  1e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  32.85 
 
 
221 aa  100  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
238 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 
219 aa  101  1e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
238 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
219 aa  101  1e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  30.58 
 
 
219 aa  100  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3751  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
239 aa  100  2e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.444301 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  30.77 
 
 
233 aa  100  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 
237 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 
214 aa  99.8  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 
233 aa  100  3e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  31.66 
 
 
220 aa  100  3e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 
233 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  29.17 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30.73 
 
 
236 aa  99.4  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.17 
 
 
237 aa  99.4  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
224 aa  99.4  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  32.52 
 
 
238 aa  98.6  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0091  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 
231 aa  98.2  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  32.02 
 
 
243 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 
222 aa  97.8  1e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  32.57 
 
 
232 aa  97.8  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>