More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0128 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 214 aa  421  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  49.3 
 
 		 220 aa  194  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  45.07 
 
 		 220 aa  182  4.0000000000000006e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  41.54 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  39.62 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  38.35 
 
 		 227 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  41.41 
 
 		 224 aa  142  4e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  38.76 
 
 		 222 aa  142  5e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  38.16 
 
 		 223 aa  141  7e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  37.68 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  38.39 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  38.83 
 
 		 223 aa  138  4.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  37.68 
 
 		 229 aa  137  1e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.49 
 
 		 228 aa  136  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1714  phosphate uptake regulator, PhoU  39.72 
 
 		 237 aa  136  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0605857  normal  0.609426 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1533  phosphate transporter PhoU  40.95 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  36.92 
 
 		 215 aa  134  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2022  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  38.94 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  40.19 
 
 		 239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  37.5 
 
 		 243 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  38.46 
 
 		 233 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 217 aa  127  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 		 220 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.97 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  38.65 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  38.65 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  38.65 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  35.58 
 
 		 235 aa  126  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  37.62 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  38.68 
 
 		 231 aa  124  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 253 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  39.13 
 
 		 242 aa  124  8.000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 		 218 aa  124  9e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2649  phosphate uptake regulator, PhoU  38.54 
 
 		 241 aa  124  1e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.436885  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  35.07 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  35.27 
 
 		 232 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  42.07 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  37.68 
 
 		 256 aa  123  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 233 aa  122  3e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  36.49 
 
 		 236 aa  122  3e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.27 
 
 		 232 aa  123  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  40.49 
 
 		 217 aa  122  3e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  39.34 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0435  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  40.67 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  40.19 
 
 		 242 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  38.76 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  37.58 
 
 		 221 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48560  phosphate transport system regulatory protein PhoU  39.22 
 
 		 247 aa  119  4.9999999999999996e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 231 aa  118  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  38.76 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 236 aa  118  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.18 
 
 		 221 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  39.02 
 
 		 233 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  116  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3625  phosphate uptake regulator, PhoU  38.27 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  37.14 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  37.14 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  37.14 
 
 		 236 aa  116  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  34.43 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  36.19 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3264  phosphate uptake regulator, PhoU  38.34 
 
 		 239 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  37.58 
 
 		 221 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  115  6e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  39.49 
 
 		 234 aa  115  6e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  34.78 
 
 		 244 aa  115  6e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  34.76 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.76 
 
 		 237 aa  115  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  34.29 
 
 		 237 aa  114  8.999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  36.19 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2163  phosphate uptake regulator, PhoU  35.71 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.125702  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 		 240 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  36.19 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0823  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2016  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.83984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  37.14 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1304  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1275  phosphate uptake regulator, PhoU  37.85 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  36.67 
 
 		 236 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  39.88 
 
 		 240 aa  112  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  34.3 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2368  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 233 aa  112  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1490  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 233 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>