More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1568 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 233 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  88.41 
 
 		 233 aa  396  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  86.7 
 
 		 233 aa  383  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  66.67 
 
 		 228 aa  306  1.0000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  52.49 
 
 		 224 aa  230  1e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.74 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  37.56 
 
 		 215 aa  142  7e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 217 aa  137  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  35.05 
 
 		 221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 216 aa  134  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  36.61 
 
 		 225 aa  132  5e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  35.02 
 
 		 240 aa  128  9.000000000000001e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  34.1 
 
 		 217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 219 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.1 
 
 		 221 aa  123  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 220 aa  123  3e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_150  phosphate transport system regulatory protein  38.01 
 
 		 221 aa  122  4e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  29.91 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 243 aa  122  5e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  30.17 
 
 		 241 aa  122  6e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 238 aa  122  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  32.09 
 
 		 215 aa  122  7e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 		 218 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  30.17 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  30.17 
 
 		 240 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  30.17 
 
 		 238 aa  121  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0228  phosphate uptake regulator, PhoU  36.62 
 
 		 221 aa  120  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3273  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0870914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 239 aa  119  3e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 214 aa  119  3e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  30.47 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  30.26 
 
 		 244 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  31.19 
 
 		 242 aa  119  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.05 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 		 237 aa  118  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  31.67 
 
 		 253 aa  118  7e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  29.74 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  29.74 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  29.74 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  29.74 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  29.74 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  29.91 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  35.35 
 
 		 220 aa  117  9.999999999999999e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  31.6 
 
 		 219 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2687  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 231 aa  117  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0840581  normal  0.852923 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  29.44 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  29.77 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 236 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1011  phosphate uptake regulatory protein  32.86 
 
 		 218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.158059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5483  phosphate transport system protein PhoU  31.67 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  31.96 
 
 		 241 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0025  phosphate uptake regulator, PhoU  27.93 
 
 		 233 aa  115  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.115861 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  29.87 
 
 		 244 aa  114  8.999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  29.55 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  30.32 
 
 		 253 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 239 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  26.61 
 
 		 226 aa  112  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  30.23 
 
 		 232 aa  112  7.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0130  phosphate uptake regulator, PhoU  28.04 
 
 		 235 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2815  transcriptional regulator PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  31.13 
 
 		 218 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1569  transcriptional regulator PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.289815  normal  0.448411 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1541  transcriptional regulator PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.756719  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  28.7 
 
 		 231 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  30.45 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1536  transcriptional regulator PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.726746  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  28.45 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  37.16 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  29.46 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.88 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.508687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  30.7 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2557  transcriptional regulator PhoU  29.73 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2624  transcriptional regulator PhoU  29.73 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0192004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2731  transcriptional regulator PhoU  29.73 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  28.45 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  29.02 
 
 		 236 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  28.76 
 
 		 241 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1726  transcriptional regulator PhoU  29.73 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  28.97 
 
 		 239 aa  110  3e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1437  transcriptional regulator PhoU  29.28 
 
 		 236 aa  109  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  28.11 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 256 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  32.56 
 
 		 216 aa  109  4.0000000000000004e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  28.25 
 
 		 232 aa  108  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0953  phosphate uptake regulator, PhoU  26.01 
 
 		 240 aa  109  5e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.627486  normal  0.0660647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>