More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0894 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 
221 aa  434  1e-121  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  62.21 
 
 
217 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  61.79 
 
 
214 aa  271  6e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  62.86 
 
 
215 aa  268  4e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  60.48 
 
 
217 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  58.14 
 
 
219 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  58.22 
 
 
219 aa  231  7.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  49.3 
 
 
220 aa  220  9.999999999999999e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  52.75 
 
 
218 aa  217  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  53.02 
 
 
223 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  51.9 
 
 
224 aa  207  1e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  48.1 
 
 
220 aa  204  7e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  47.91 
 
 
220 aa  204  7e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  50.47 
 
 
219 aa  204  9e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  48.34 
 
 
220 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  50.71 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  50.71 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  50.71 
 
 
222 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  53.49 
 
 
231 aa  196  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  49.31 
 
 
238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
222 aa  193  2e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  49.76 
 
 
213 aa  192  3e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.26 
 
 
220 aa  191  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  49.05 
 
 
222 aa  188  4e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 
220 aa  187  8e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  49.52 
 
 
226 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  45.54 
 
 
220 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  46.95 
 
 
232 aa  180  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  48.64 
 
 
225 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
220 aa  179  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 
222 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  46.23 
 
 
226 aa  172  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  44.76 
 
 
221 aa  167  1e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  47.39 
 
 
214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  46.67 
 
 
222 aa  166  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  38.1 
 
 
226 aa  162  3e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  48.34 
 
 
214 aa  159  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  41.9 
 
 
230 aa  153  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  40.48 
 
 
224 aa  150  2e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  40.95 
 
 
216 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3204  phosphate uptake regulator, PhoU  41.51 
 
 
234 aa  128  8.000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  35.1 
 
 
239 aa  127  9.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  38.28 
 
 
239 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.38 
 
 
237 aa  124  9e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 
237 aa  124  9e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  34.91 
 
 
237 aa  124  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  34.6 
 
 
240 aa  124  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  35.21 
 
 
236 aa  124  1e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.17 
 
 
238 aa  123  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  36.54 
 
 
243 aa  123  2e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  28.37 
 
 
215 aa  118  7e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0201  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 
242 aa  116  1.9999999999999998e-25  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.440997  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  29.95 
 
 
218 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  26.64 
 
 
228 aa  115  6e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  34.45 
 
 
228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 
217 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  33.81 
 
 
243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  31.02 
 
 
221 aa  112  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 
219 aa  113  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  26.29 
 
 
233 aa  112  6e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
223 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  32.7 
 
 
223 aa  112  6e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  30.81 
 
 
220 aa  111  7.000000000000001e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.58 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  32.56 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0488  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.99 
 
 
235 aa  111  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.18906  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.58 
 
 
240 aa  111  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 
238 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  31.58 
 
 
240 aa  109  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 
239 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
238 aa  109  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  35.41 
 
 
232 aa  109  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 
238 aa  109  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  33.18 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  25.82 
 
 
233 aa  108  5e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 
223 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  32.87 
 
 
220 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0172  phosphate uptake regulator, PhoU  30.09 
 
 
237 aa  108  8.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.165453  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 
229 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 
238 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0182  phosphate uptake regulator, PhoU  30.36 
 
 
237 aa  108  9.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497891 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  30.28 
 
 
216 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  28.1 
 
 
214 aa  107  2e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  35.1 
 
 
228 aa  107  2e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  31.16 
 
 
218 aa  107  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 
223 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
233 aa  106  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 
226 aa  106  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  27.64 
 
 
233 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 
220 aa  105  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0011  phosphate uptake regulator, PhoU  30.41 
 
 
242 aa  105  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.222321  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0123  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 
237 aa  105  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
241 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
241 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 
233 aa  105  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 
216 aa  105  7e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 
236 aa  104  8e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  32.69 
 
 
242 aa  104  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1224  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.19 
 
 
240 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.123271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>