More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_03680 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  100 
 
 		 226 aa  443  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  49.52 
 
 		 221 aa  186  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0469  phosphate uptake regulator, PhoU  47.87 
 
 		 215 aa  181  7e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  47.25 
 
 		 217 aa  177  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  45.97 
 
 		 214 aa  176  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 219 aa  169  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  46.01 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  45.79 
 
 		 232 aa  161  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0698  phosphate uptake regulator, PhoU  43.72 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2085  phosphate uptake regulator, PhoU  42.06 
 
 		 222 aa  159  5e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.252335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0848  phosphate uptake regulator, PhoU  40.45 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  44.55 
 
 		 219 aa  155  6e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4514  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4601  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4897  phosphate uptake regulator, PhoU  43.81 
 
 		 222 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6815  phosphate uptake regulator, PhoU  42.2 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.289636  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37610  phosphate uptake regulator, PhoU  41.74 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.141412 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  44.34 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31900  phosphate uptake regulator, PhoU  43.4 
 
 		 223 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1665  phosphate uptake regulator, PhoU  42.04 
 
 		 222 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3921  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.65 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4320  phosphate uptake regulator, PhoU  40.28 
 
 		 220 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0497  phosphate uptake regulator, PhoU  42.59 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.839068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1780  phosphate uptake regulator  39.42 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.210752  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09310  phosphate transport system regulatory protein PhoU  42.59 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  43.87 
 
 		 222 aa  146  3e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3538  phosphate uptake regulator, PhoU  41.01 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0722  phosphate uptake regulator, PhoU  40.09 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10836  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY2  40.95 
 
 		 213 aa  144  1e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142472 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0090  phosphate uptake regulator, PhoU  42.52 
 
 		 220 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5088  phosphate uptake regulator, PhoU  43.33 
 
 		 222 aa  139  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4977  phosphate uptake regulator, PhoU  41.71 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0395  phosphate transport system regulatory protein PhoU  37.14 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  38.79 
 
 		 238 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2908  phosphate uptake regulator, PhoU  41.01 
 
 		 231 aa  131  9e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13330  phosphate-transport system transcriptional regulatory protein phoY1  36.79 
 
 		 221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2218  phosphate uptake regulator, PhoU  36.57 
 
 		 216 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0150232 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.16 
 
 		 219 aa  118  6e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0285  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.376291  normal  0.13988 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 228 aa  115  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  34.98 
 
 		 238 aa  114  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0329  phosphate uptake regulator, PhoU  37.91 
 
 		 214 aa  112  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0770036  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 227 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.56 
 
 		 221 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1601  phosphate uptake regulator, PhoU  32.39 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000531756  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 217 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  33.79 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  32.71 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  29.11 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  33.02 
 
 		 220 aa  106  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  27.98 
 
 		 218 aa  105  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  34.88 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  30.23 
 
 		 220 aa  105  5e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  34.12 
 
 		 230 aa  105  7e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  32.24 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  34.62 
 
 		 228 aa  103  2e-21  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1560  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0839  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 220 aa  103  2e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  31.75 
 
 		 232 aa  103  3e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  30.18 
 
 		 226 aa  102  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  34.23 
 
 		 237 aa  102  5e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 217 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2550  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3556  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.482347 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  32.3 
 
 		 236 aa  100  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1541  phosphate uptake regulator, PhoU  32.16 
 
 		 220 aa  99.4  4e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000266211  normal  0.024088 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.89 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  32.75 
 
 		 228 aa  97.8  1e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2739  phosphate uptake regulator PhoU  32.21 
 
 		 221 aa  97.8  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0103361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 219 aa  97.8  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1906  phosphate uptake regulator, PhoU  34.7 
 
 		 218 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2837  phosphate uptake regulator, PhoU  29.05 
 
 		 214 aa  97.4  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  34.33 
 
 		 239 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  30.87 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  32.42 
 
 		 218 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.87 
 
 		 237 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  30.84 
 
 		 219 aa  96.3  4e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.11 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0621  phosphate uptake regulator, PhoU  28.77 
 
 		 226 aa  96.3  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1596  phosphate uptake regulator, PhoU  35.27 
 
 		 224 aa  95.9  4e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.215109  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  29.11 
 
 		 215 aa  95.9  5e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  30.33 
 
 		 228 aa  95.9  5e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  33.97 
 
 		 230 aa  95.1  8e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 218 aa  95.1  8e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 241 aa  95.1  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  29.63 
 
 		 233 aa  94.4  1e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3367  phosphate uptake regulator, PhoU  30.48 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.812855 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 240 aa  94  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  31.65 
 
 		 231 aa  93.6  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.07 
 
 		 224 aa  93.6  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  32.41 
 
 		 236 aa  94  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  33.64 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>