More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1678 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 219 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  75.8 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  77.1 
 
 		 228 aa  332  3e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  74.89 
 
 		 228 aa  325  4.0000000000000003e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  70.78 
 
 		 228 aa  310  1e-83  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0947  phosphate uptake regulator, PhoU  57.99 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.710255 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1237  phosphate uptake regulator, PhoU  58.9 
 
 		 228 aa  257  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316585  normal  0.224996 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0380  phosphate uptake regulator, PhoU  55.71 
 
 		 232 aa  253  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0239485  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0432  hypothetical protein  56.76 
 
 		 223 aa  241  5e-63  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2864  phosphate uptake regulator, PhoU  50.23 
 
 		 228 aa  208  6e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0659  negative regulator for pho regulon and putative enzyme in phosphate metabolism  44.02 
 
 		 215 aa  139  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  38.5 
 
 		 215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1929  phosphate uptake regulator, PhoU  43.41 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0982293  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  40.61 
 
 		 224 aa  130  1.0000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1825  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 232 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0729342  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1095  phosphate transport system regulatory protein PhoU  35.75 
 
 		 228 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2705  phosphate uptake regulator, PhoU  35.68 
 
 		 229 aa  128  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1818  phosphate uptake regulator, PhoU  38.42 
 
 		 230 aa  126  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  38.74 
 
 		 217 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1514  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.875491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2562  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 223 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000003122  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1848  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 223 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  34.78 
 
 		 224 aa  118  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1717  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 223 aa  118  7.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  36.14 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1415  phosphate uptake regulator, PhoU  36.06 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000133646  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  35.12 
 
 		 234 aa  114  7.999999999999999e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0622  phosphate uptake regulator, PhoU  33.82 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  34.09 
 
 		 219 aa  111  9e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4578  phosphate uptake regulator, PhoU  34.4 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.92814  normal  0.180696 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  36.61 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1863  phosphate uptake regulator, PhoU  34 
 
 		 227 aa  108  4.0000000000000004e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4118  phosphate uptake regulator, PhoU  30.92 
 
 		 233 aa  108  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4002  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.584217  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  35.15 
 
 		 219 aa  107  1e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4144  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 233 aa  107  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2971  phosphate uptake regulator, PhoU  33.49 
 
 		 222 aa  106  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  31.53 
 
 		 219 aa  105  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0422  phosphate uptake regulator, PhoU  30.29 
 
 		 231 aa  105  8e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.980511 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1923  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.602202  normal  0.424531 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0398  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 217 aa  103  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5372  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  102  5e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.411001 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8217  phosphate uptake regulator, PhoU  35.38 
 
 		 217 aa  102  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.864865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0710  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 218 aa  102  5e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6147  phosphate uptake regulator, PhoU  33.96 
 
 		 214 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.557412  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5325  phosphate transporter PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0100793 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1568  phosphate uptake regulator, PhoU  31.8 
 
 		 233 aa  102  6e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2600  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5233  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.229309 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1258  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0128  phosphate uptake regulator, PhoU  32.74 
 
 		 214 aa  101  7e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.244717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0478  phosphate uptake regulator, PhoU  30.19 
 
 		 218 aa  101  8e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19340  phosphate uptake regulator, PhoU  32.98 
 
 		 217 aa  101  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6144  phosphate transporter PhoU  34.21 
 
 		 242 aa  100  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0894  phosphate uptake regulator, PhoU  34.13 
 
 		 221 aa  101  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  hitchhiker  0.000480176 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0351  phosphate uptake regulator, PhoU  32.06 
 
 		 233 aa  101  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00165088 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5611  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.401976  normal  0.199229 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03730  phosphate uptake regulator, PhoU  33.8 
 
 		 222 aa  101  1e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0356664  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3448  phosphate uptake regulator, PhoU  41.25 
 
 		 230 aa  100  1e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.741283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0012  phosphate uptake regulator, PhoU  34.52 
 
 		 220 aa  100  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224503  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0183  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1350  phosphate regulon transcriptional regulator  30.1 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.026739  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3412  phosphate uptake regulator, PhoU  34.04 
 
 		 243 aa  99.8  3e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.795673 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1286  phosphate uptake regulator, PhoU  30.1 
 
 		 240 aa  99.8  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70800  phosphate uptake regulatory protein PhoU  33.68 
 
 		 242 aa  99.8  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.611464 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4604  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.52 
 
 		 243 aa  99.4  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0424  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 228 aa  99.4  4e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0655  phosphate uptake regulator, PhoU  33.65 
 
 		 224 aa  99.4  4e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0834345  hitchhiker  0.000018178 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0149  phosphate uptake regulator, PhoU  30.95 
 
 		 256 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2293  phosphate uptake regulator, PhoU  31.52 
 
 		 236 aa  98.6  6e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.612527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0483  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 216 aa  98.6  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  31.36 
 
 		 218 aa  98.6  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  33.15 
 
 		 225 aa  98.6  7e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0769  phosphate uptake regulator, PhoU  33.14 
 
 		 232 aa  98.2  8e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.178103  normal  0.488528 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03680  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.25 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  31.48 
 
 		 222 aa  97.8  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4326  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.545829  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2549  phosphate uptake regulator, PhoU  27.4 
 
 		 226 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0645405 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1511  phosphate uptake regulator, PhoU  29.86 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3314  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 233 aa  96.7  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00113393  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2362  phosphate uptake regulator, PhoU  29.91 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.488645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4044  phosphate uptake regulator, PhoU  32.86 
 
 		 238 aa  97.1  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1014  phosphate uptake regulator, PhoU  31.9 
 
 		 220 aa  96.7  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0485  phosphate uptake regulator, PhoU  29.41 
 
 		 233 aa  96.3  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.89743  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00536  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.58 
 
 		 236 aa  96.3  3e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.110007  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  32.07 
 
 		 216 aa  96.3  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1542  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 234 aa  96.3  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0547661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1537  phosphate transport system protein  27.32 
 
 		 237 aa  95.9  4e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.290389 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0959  phosphate uptake regulator, PhoU  34.93 
 
 		 219 aa  95.9  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5037  hypothetical protein  31.53 
 
 		 253 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.638399  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  29.9 
 
 		 220 aa  95.9  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0835  phosphate uptake regulator, PhoU  30.05 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00587435 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0573  phosphate uptake regulator, PhoU  28.5 
 
 		 224 aa  95.5  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0470  phosphate uptake regulator, PhoU  35.48 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  27.62 
 
 		 234 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>